RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
NHLH2-201ENST00000320238 TOPBP1Q92547 1522 aa28.16■■■□□ 2.1
NHLH2-201ENST00000320238 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.16■■■□□ 2.1
NHLH2-201ENST00000320238 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.16■■■□□ 2.1
NHLH2-201ENST00000320238 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.15■■■□□ 2.1
NHLH2-201ENST00000320238 TIAM1Q13009 1591 aa28.14■■■□□ 2.1
NHLH2-201ENST00000320238 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.12■■■□□ 2.09
NHLH2-201ENST00000320238 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.11■■■□□ 2.09
NHLH2-201ENST00000320238 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.11■■■□□ 2.09
NHLH2-201ENST00000320238 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
NHLH2-201ENST00000320238 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.07■■■□□ 2.08
NHLH2-201ENST00000320238 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.05■■■□□ 2.08
NHLH2-201ENST00000320238 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
NHLH2-201ENST00000320238 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
NHLH2-201ENST00000320238 MAP3K1Q13233 1512 aa27.96■■■□□ 2.07
NHLH2-201ENST00000320238 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.95■■■□□ 2.07
NHLH2-201ENST00000320238 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.93■■■□□ 2.06
NHLH2-201ENST00000320238 MAPKBP1O60336 1514 aa27.88■■■□□ 2.05
NHLH2-201ENST00000320238 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.84■■■□□ 2.05
NHLH2-201ENST00000320238 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.82■■■□□ 2.04
NHLH2-201ENST00000320238 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.81■■■□□ 2.04
NHLH2-201ENST00000320238 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.81■■■□□ 2.04
NHLH2-201ENST00000320238 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.8■■■□□ 2.04
NHLH2-201ENST00000320238 CUL7Q14999 1698 aa27.79■■■□□ 2.04
NHLH2-201ENST00000320238 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.79■■■□□ 2.04
NHLH2-201ENST00000320238 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.78■■■□□ 2.04
NHLH2-201ENST00000320238 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.78■■■□□ 2.04
NHLH2-201ENST00000320238 FMN1Q68DA7 1419 aa27.76■■■□□ 2.03
NHLH2-201ENST00000320238 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
NHLH2-201ENST00000320238 ARID3CA6NKF2 412 aa27.73■■■□□ 2.03
NHLH2-201ENST00000320238 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.72■■■□□ 2.03
NHLH2-201ENST00000320238 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.7■■■□□ 2.03
NHLH2-201ENST00000320238 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.69■■■□□ 2.02
NHLH2-201ENST00000320238 KCNH8Q96L42 1107 aa27.68■■■□□ 2.02
NHLH2-201ENST00000320238 WDR97A6NE52 1622 aa27.67■■■□□ 2.02
NHLH2-201ENST00000320238 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.67■■■□□ 2.02
NHLH2-201ENST00000320238 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.67■■■□□ 2.02
NHLH2-201ENST00000320238 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.64■■■□□ 2.01
NHLH2-201ENST00000320238 PTPRKQ15262 1439 aa27.63■■■□□ 2.01
NHLH2-201ENST00000320238 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
NHLH2-201ENST00000320238 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.57■■■□□ 2
NHLH2-201ENST00000320238 NCOA2Q15596 1464 aa27.56■■■□□ 2
NHLH2-201ENST00000320238 SAMD9Q5K651 1589 aa27.55■■■□□ 2
NHLH2-201ENST00000320238 GRIN2BQ13224 1484 aa27.53■■■□□ 2
NHLH2-201ENST00000320238 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
NHLH2-201ENST00000320238 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.52■■■□□ 2
NHLH2-201ENST00000320238 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.51■■□□□ 1.99
NHLH2-201ENST00000320238 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
NHLH2-201ENST00000320238 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.5■■□□□ 1.99
NHLH2-201ENST00000320238 MYT1Q01538 1121 aa27.49■■□□□ 1.99
NHLH2-201ENST00000320238 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.48■■□□□ 1.99
NHLH2-201ENST00000320238 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.45■■□□□ 1.98
NHLH2-201ENST00000320238 TONSLQ96HA7 1378 aa27.44■■□□□ 1.98
NHLH2-201ENST00000320238 HFM1A2PYH4 1435 aa27.43■■□□□ 1.98
NHLH2-201ENST00000320238 NAIPQ13075 1403 aa27.41■■□□□ 1.98
NHLH2-201ENST00000320238 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.39■■□□□ 1.98
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
NHLH2-201ENST00000320238 TRIM52Q96A61 297 aa27.37■■□□□ 1.97
NHLH2-201ENST00000320238 UACAQ9BZF9 1416 aa27.37■■□□□ 1.97
NHLH2-201ENST00000320238 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.36■■□□□ 1.97
NHLH2-201ENST00000320238 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
NHLH2-201ENST00000320238 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.35■■□□□ 1.97
NHLH2-201ENST00000320238 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
NHLH2-201ENST00000320238 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.33■■□□□ 1.97
NHLH2-201ENST00000320238 IQGAP2Q13576 1575 aa27.32■■□□□ 1.96
NHLH2-201ENST00000320238 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
NHLH2-201ENST00000320238 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.31■■□□□ 1.96
NHLH2-201ENST00000320238 PBRM1Q86U86 1689 aa27.31■■□□□ 1.96
NHLH2-201ENST00000320238 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
NHLH2-201ENST00000320238 FOXD1Q16676 465 aa27.28■■□□□ 1.96
NHLH2-201ENST00000320238 ADAMTS12P58397 1594 aa27.27■■□□□ 1.96
NHLH2-201ENST00000320238 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGEF11O15085 1522 aa27.23■■□□□ 1.95
NHLH2-201ENST00000320238 FBLN2P98095 1184 aa27.23■■□□□ 1.95
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
NHLH2-201ENST00000320238 HECW1Q76N89 1606 aa27.22■■□□□ 1.95
NHLH2-201ENST00000320238 ANP32CO43423 234 aa27.19■■□□□ 1.94
NHLH2-201ENST00000320238 KDM6BO15054 1643 aa27.16■■□□□ 1.94
NHLH2-201ENST00000320238 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.15■■□□□ 1.94
NHLH2-201ENST00000320238 WDR62O43379 1518 aa27.15■■□□□ 1.94
NHLH2-201ENST00000320238 IFT140Q96RY7 1462 aa27.14■■□□□ 1.94
NHLH2-201ENST00000320238 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
NHLH2-201ENST00000320238 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
NHLH2-201ENST00000320238 BCANQ96GW7 911 aa27.12■■□□□ 1.93
NHLH2-201ENST00000320238 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
NHLH2-201ENST00000320238 DISP1Q96F81 1524 aa27.1■■□□□ 1.93
NHLH2-201ENST00000320238 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.07■■□□□ 1.92
NHLH2-201ENST00000320238 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.06■■□□□ 1.92
NHLH2-201ENST00000320238 MIA2Q96PC5 1412 aa27.06■■□□□ 1.92
NHLH2-201ENST00000320238 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
NHLH2-201ENST00000320238 ERCC6Q03468 1493 aa27.05■■□□□ 1.92
NHLH2-201ENST00000320238 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.05■■□□□ 1.92
NHLH2-201ENST00000320238 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NHLH2-201ENST00000320238 GRIN2AQ12879 1464 aa27.03■■□□□ 1.92
NHLH2-201ENST00000320238 KIAA0556O60303 1618 aa27.01■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 DAPK1P53355 1430 aa26.99■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 CCER2I3L3R5 266 aa26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms