RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.96■■■■□ 3.51
HOXB3-201ENST00000311626 NESP48681 1621 aa36.94■■■■□ 3.5
HOXB3-201ENST00000311626 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.93■■■■□ 3.5
HOXB3-201ENST00000311626 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXB3-201ENST00000311626 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.87■■■■□ 3.49
HOXB3-201ENST00000311626 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
HOXB3-201ENST00000311626 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
HOXB3-201ENST00000311626 TOPBP1Q92547 1522 aa36.78■■■■□ 3.48
HOXB3-201ENST00000311626 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXB3-201ENST00000311626 MAP3K1Q13233 1512 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXB3-201ENST00000311626 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXB3-201ENST00000311626 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.74■■■■□ 3.47
HOXB3-201ENST00000311626 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.74■■■■□ 3.47
HOXB3-201ENST00000311626 MAPKBP1O60336 1514 aa36.73■■■■□ 3.47
HOXB3-201ENST00000311626 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.69■■■■□ 3.46
HOXB3-201ENST00000311626 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.62■■■■□ 3.45
HOXB3-201ENST00000311626 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-201ENST00000311626 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.59■■■■□ 3.45
HOXB3-201ENST00000311626 KCNH8Q96L42 1107 aa36.55■■■■□ 3.44
HOXB3-201ENST00000311626 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
HOXB3-201ENST00000311626 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXB3-201ENST00000311626 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
HOXB3-201ENST00000311626 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.49■■■■□ 3.43
HOXB3-201ENST00000311626 WDR97A6NE52 1622 aa36.46■■■■□ 3.43
HOXB3-201ENST00000311626 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.43■■■■□ 3.42
HOXB3-201ENST00000311626 CUL7Q14999 1698 aa36.42■■■■□ 3.42
HOXB3-201ENST00000311626 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
HOXB3-201ENST00000311626 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.41■■■■□ 3.42
HOXB3-201ENST00000311626 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.36■■■■□ 3.41
HOXB3-201ENST00000311626 FMN1Q68DA7 1419 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXB3-201ENST00000311626 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.33■■■■□ 3.413e-7■■■■□ 23.1
HOXB3-201ENST00000311626 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-201ENST00000311626 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-201ENST00000311626 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-201ENST00000311626 PTPRKQ15262 1439 aa36.27■■■■□ 3.4
HOXB3-201ENST00000311626 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.26■■■■□ 3.4
HOXB3-201ENST00000311626 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
HOXB3-201ENST00000311626 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
HOXB3-201ENST00000311626 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.2■■■■□ 3.39
HOXB3-201ENST00000311626 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXB3-201ENST00000311626 ARID3CA6NKF2 412 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXB3-201ENST00000311626 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-201ENST00000311626 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.16■■■■□ 3.38
HOXB3-201ENST00000311626 NCOA2Q15596 1464 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXB3-201ENST00000311626 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXB3-201ENST00000311626 SAMD9Q5K651 1589 aa36.12■■■■□ 3.37
HOXB3-201ENST00000311626 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-201ENST00000311626 GRIN2BQ13224 1484 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-201ENST00000311626 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-201ENST00000311626 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXB3-201ENST00000311626 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXB3-201ENST00000311626 TONSLQ96HA7 1378 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXB3-201ENST00000311626 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.04■■■■□ 3.36
HOXB3-201ENST00000311626 HFM1A2PYH4 1435 aa36.02■■■■□ 3.36
HOXB3-201ENST00000311626 NAIPQ13075 1403 aa36■■■■□ 3.35
HOXB3-201ENST00000311626 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXB3-201ENST00000311626 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXB3-201ENST00000311626 UACAQ9BZF9 1416 aa35.97■■■■□ 3.35
HOXB3-201ENST00000311626 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
HOXB3-201ENST00000311626 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
HOXB3-201ENST00000311626 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXB3-201ENST00000311626 TRIM52Q96A61 297 aa35.88■■■■□ 3.34
HOXB3-201ENST00000311626 BCANQ96GW7 911 aa35.88■■■■□ 3.34
HOXB3-201ENST00000311626 ANP32CO43423 234 aa35.85■■■■□ 3.33
HOXB3-201ENST00000311626 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.85■■■■□ 3.33
HOXB3-201ENST00000311626 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
HOXB3-201ENST00000311626 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
HOXB3-201ENST00000311626 FOXD1Q16676 465 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXB3-201ENST00000311626 PBRM1Q86U86 1689 aa35.76■■■■□ 3.32
HOXB3-201ENST00000311626 ARHGEF11O15085 1522 aa35.74■■■■□ 3.31
HOXB3-201ENST00000311626 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
HOXB3-201ENST00000311626 IQGAP2Q13576 1575 aa35.74■■■■□ 3.31
HOXB3-201ENST00000311626 FKBP8Q14318 412 aa35.72■■■■□ 3.31
HOXB3-201ENST00000311626 KDM6BO15054 1643 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXB3-201ENST00000311626 HECW1Q76N89 1606 aa35.68■■■■□ 3.3
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
HOXB3-201ENST00000311626 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXB3-201ENST00000311626 CCER2I3L3R5 266 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-201ENST00000311626 ADAMTS12P58397 1594 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-201ENST00000311626 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-201ENST00000311626 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
HOXB3-201ENST00000311626 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
HOXB3-201ENST00000311626 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
HOXB3-201ENST00000311626 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa35.61■■■■□ 3.29
HOXB3-201ENST00000311626 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXB3-201ENST00000311626 WDR62O43379 1518 aa35.57■■■■□ 3.29
HOXB3-201ENST00000311626 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.53■■■■□ 3.28
HOXB3-201ENST00000311626 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.52■■■■□ 3.28
HOXB3-201ENST00000311626 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.5■■■■□ 3.27
HOXB3-201ENST00000311626 MIA2Q96PC5 1412 aa35.47■■■■□ 3.27
HOXB3-201ENST00000311626 DISP1Q96F81 1524 aa35.42■■■■□ 3.26
HOXB3-201ENST00000311626 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.41■■■■□ 3.264e-7■■■□□ 18.3
HOXB3-201ENST00000311626 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
HOXB3-201ENST00000311626 NEFLP07196 543 aa35.4■■■■□ 3.26
HOXB3-201ENST00000311626 DAPK1P53355 1430 aa35.39■■■■□ 3.26
HOXB3-201ENST00000311626 FBLN2P98095 1184 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXB3-201ENST00000311626 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP35.37■■■■□ 3.25
HOXB3-201ENST00000311626 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
HOXB3-201ENST00000311626 ABCC5O15440 1437 aa35.37■■■■□ 3.25
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