RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.87■■■□□ 2.53
PTDSS2-201ENST00000308020 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.82■■■□□ 2.52
PTDSS2-201ENST00000308020 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.82■■■□□ 2.52
PTDSS2-201ENST00000308020 ITGAEP38570 1179 aa30.79■■■□□ 2.52
PTDSS2-201ENST00000308020 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PTDSS2-201ENST00000308020 TIAM1Q13009 1591 aa30.76■■■□□ 2.52
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
PTDSS2-201ENST00000308020 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.72■■■□□ 2.51
PTDSS2-201ENST00000308020 MAP3K1Q13233 1512 aa30.7■■■□□ 2.51
PTDSS2-201ENST00000308020 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
PTDSS2-201ENST00000308020 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.68■■■□□ 2.5
PTDSS2-201ENST00000308020 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.68■■■□□ 2.5
PTDSS2-201ENST00000308020 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.67■■■□□ 2.5
PTDSS2-201ENST00000308020 CUL7Q14999 1698 aa30.67■■■□□ 2.5
PTDSS2-201ENST00000308020 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR97A6NE52 1622 aa30.6■■■□□ 2.49
PTDSS2-201ENST00000308020 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.59■■■□□ 2.49
PTDSS2-201ENST00000308020 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.56■■■□□ 2.48
PTDSS2-201ENST00000308020 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.55■■■□□ 2.48
PTDSS2-201ENST00000308020 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.55■■■□□ 2.48
PTDSS2-201ENST00000308020 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.55■■■□□ 2.48
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PTDSS2-201ENST00000308020 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.52■■■□□ 2.48
PTDSS2-201ENST00000308020 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.51■■■□□ 2.48
PTDSS2-201ENST00000308020 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.51■■■□□ 2.47
PTDSS2-201ENST00000308020 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.49■■■□□ 2.47
PTDSS2-201ENST00000308020 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.48■■■□□ 2.47
PTDSS2-201ENST00000308020 FMN1Q68DA7 1419 aa30.42■■■□□ 2.46
PTDSS2-201ENST00000308020 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.462e-7■■■■□ 23.2
PTDSS2-201ENST00000308020 MAPKBP1O60336 1514 aa30.38■■■□□ 2.45
PTDSS2-201ENST00000308020 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.38■■■□□ 2.45
PTDSS2-201ENST00000308020 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PTDSS2-201ENST00000308020 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.33■■■□□ 2.45
PTDSS2-201ENST00000308020 SAMD9Q5K651 1589 aa30.3■■■□□ 2.44
PTDSS2-201ENST00000308020 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.27■■■□□ 2.44
PTDSS2-201ENST00000308020 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.21■■■□□ 2.43
PTDSS2-201ENST00000308020 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.2■■■□□ 2.42
PTDSS2-201ENST00000308020 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.18■■■□□ 2.42
PTDSS2-201ENST00000308020 PBRM1Q86U86 1689 aa30.18■■■□□ 2.42
PTDSS2-201ENST00000308020 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.18■■■□□ 2.42
PTDSS2-201ENST00000308020 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.421e-6■■□□□ 11.5
PTDSS2-201ENST00000308020 GRIN2BQ13224 1484 aa30.17■■■□□ 2.42
PTDSS2-201ENST00000308020 NCOA2Q15596 1464 aa30.08■■■□□ 2.41
PTDSS2-201ENST00000308020 ADAMTS12P58397 1594 aa30.07■■■□□ 2.4
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNH8Q96L42 1107 aa30.06■■■□□ 2.4
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PTDSS2-201ENST00000308020 IQGAP2Q13576 1575 aa30.04■■■□□ 2.4
PTDSS2-201ENST00000308020 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PTDSS2-201ENST00000308020 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.02■■■□□ 2.4
PTDSS2-201ENST00000308020 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PTDSS2-201ENST00000308020 PTPRKQ15262 1439 aa30.01■■■□□ 2.4
PTDSS2-201ENST00000308020 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
PTDSS2-201ENST00000308020 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
PTDSS2-201ENST00000308020 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.99■■■□□ 2.39
PTDSS2-201ENST00000308020 IFT140Q96RY7 1462 aa29.98■■■□□ 2.39
PTDSS2-201ENST00000308020 ARID3CA6NKF2 412 aa29.98■■■□□ 2.39
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.97■■■□□ 2.39
PTDSS2-201ENST00000308020 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.97■■■□□ 2.39
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.95■■■□□ 2.39
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR62O43379 1518 aa29.93■■■□□ 2.38
PTDSS2-201ENST00000308020 HFM1A2PYH4 1435 aa29.92■■■□□ 2.38
PTDSS2-201ENST00000308020 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PTDSS2-201ENST00000308020 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.91■■■□□ 2.38
PTDSS2-201ENST00000308020 HECW1Q76N89 1606 aa29.91■■■□□ 2.38
PTDSS2-201ENST00000308020 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PTDSS2-201ENST00000308020 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PTDSS2-201ENST00000308020 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.87■■■□□ 2.37
PTDSS2-201ENST00000308020 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGEF11O15085 1522 aa29.86■■■□□ 2.37
PTDSS2-201ENST00000308020 NAIPQ13075 1403 aa29.85■■■□□ 2.37
PTDSS2-201ENST00000308020 ERCC6Q03468 1493 aa29.83■■■□□ 2.37
PTDSS2-201ENST00000308020 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.83■■■□□ 2.37
PTDSS2-201ENST00000308020 UACAQ9BZF9 1416 aa29.82■■■□□ 2.36
PTDSS2-201ENST00000308020 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.81■■■□□ 2.36
PTDSS2-201ENST00000308020 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.79■■■□□ 2.36
PTDSS2-201ENST00000308020 TONSLQ96HA7 1378 aa29.78■■■□□ 2.36
PTDSS2-201ENST00000308020 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
PTDSS2-201ENST00000308020 GRIN2AQ12879 1464 aa29.75■■■□□ 2.35
PTDSS2-201ENST00000308020 DISP1Q96F81 1524 aa29.75■■■□□ 2.35
PTDSS2-201ENST00000308020 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
PTDSS2-201ENST00000308020 KIAA0556O60303 1618 aa29.71■■■□□ 2.35
PTDSS2-201ENST00000308020 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
PTDSS2-201ENST00000308020 FBLN2P98095 1184 aa29.7■■■□□ 2.35
PTDSS2-201ENST00000308020 MIA2Q96PC5 1412 aa29.66■■■□□ 2.34
PTDSS2-201ENST00000308020 ANP32CO43423 234 aa29.64■■■□□ 2.34
PTDSS2-201ENST00000308020 TRIM52Q96A61 297 aa29.64■■■□□ 2.34
PTDSS2-201ENST00000308020 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PTDSS2-201ENST00000308020 CCER2I3L3R5 266 aa29.6■■■□□ 2.33
PTDSS2-201ENST00000308020 MYT1Q01538 1121 aa29.59■■■□□ 2.33
PTDSS2-201ENST00000308020 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.58■■■□□ 2.33
PTDSS2-201ENST00000308020 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PTDSS2-201ENST00000308020 SYNJ2O15056 1496 aa29.56■■■□□ 2.32
PTDSS2-201ENST00000308020 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.56■■■□□ 2.32
PTDSS2-201ENST00000308020 KDM6BO15054 1643 aa29.55■■■□□ 2.32
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PTDSS2-201ENST00000308020 CEP170Q5SW79 1584 aa29.55■■■□□ 2.32
PTDSS2-201ENST00000308020 BCANQ96GW7 911 aa29.53■■■□□ 2.32
PTDSS2-201ENST00000308020 AKNAQ7Z591 1439 aa29.53■■■□□ 2.32
PTDSS2-201ENST00000308020 FKBP8Q14318 412 aa29.52■■■□□ 2.32
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