RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306732.7

PITX2-201, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX2, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-201ENST00000306732 MAP3K1Q13233 1512 aa28.29■■■□□ 2.12
PITX2-201ENST00000306732 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.26■■■□□ 2.11
PITX2-201ENST00000306732 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.25■■■□□ 2.11
PITX2-201ENST00000306732 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.24■■■□□ 2.11
PITX2-201ENST00000306732 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.23■■■□□ 2.11
PITX2-201ENST00000306732 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.21■■■□□ 2.11
PITX2-201ENST00000306732 WDR97A6NE52 1622 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX2-201ENST00000306732 NESP48681 1621 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX2-201ENST00000306732 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.18■■■□□ 2.1
PITX2-201ENST00000306732 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX2-201ENST00000306732 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.14■■■□□ 2.1
PITX2-201ENST00000306732 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PITX2-201ENST00000306732 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PITX2-201ENST00000306732 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX2-201ENST00000306732 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PITX2-201ENST00000306732 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.08■■■□□ 2.09
PITX2-201ENST00000306732 P3H3Q8IVL6 736 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX2-201ENST00000306732 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.03■■■□□ 2.08
PITX2-201ENST00000306732 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
PITX2-201ENST00000306732 BCANQ96GW7 911 aa28.01■■■□□ 2.07
PITX2-201ENST00000306732 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
PITX2-201ENST00000306732 TOPBP1Q92547 1522 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX2-201ENST00000306732 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
PITX2-201ENST00000306732 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX2-201ENST00000306732 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX2-201ENST00000306732 FKBP8Q14318 412 aa27.96■■■□□ 2.07
PITX2-201ENST00000306732 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.95■■■□□ 2.07
PITX2-201ENST00000306732 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
PITX2-201ENST00000306732 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.93■■■□□ 2.06
PITX2-201ENST00000306732 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.9■■■□□ 2.06
PITX2-201ENST00000306732 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.88■■■□□ 2.05
PITX2-201ENST00000306732 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
PITX2-201ENST00000306732 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.85■■■□□ 2.05
PITX2-201ENST00000306732 CCER2I3L3R5 266 aa27.84■■■□□ 2.05
PITX2-201ENST00000306732 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.84■■■□□ 2.05
PITX2-201ENST00000306732 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.83■■■□□ 2.04
PITX2-201ENST00000306732 TRIM52Q96A61 297 aa27.82■■■□□ 2.04
PITX2-201ENST00000306732 ANP32CO43423 234 aa27.81■■■□□ 2.04
PITX2-201ENST00000306732 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
PITX2-201ENST00000306732 CUL7Q14999 1698 aa27.8■■■□□ 2.04
PITX2-201ENST00000306732 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.78■■■□□ 2.04
PITX2-201ENST00000306732 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PITX2-201ENST00000306732 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX2-201ENST00000306732 TONSLQ96HA7 1378 aa27.75■■■□□ 2.03
PITX2-201ENST00000306732 NEFLP07196 543 aa27.74■■■□□ 2.03
PITX2-201ENST00000306732 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.73■■■□□ 2.03
PITX2-201ENST00000306732 PTPRKQ15262 1439 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX2-201ENST00000306732 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX2-201ENST00000306732 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.72■■■□□ 2.03
PITX2-201ENST00000306732 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.69■■■□□ 2.02
PITX2-201ENST00000306732 HFM1A2PYH4 1435 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX2-201ENST00000306732 UACAQ9BZF9 1416 aa27.68■■■□□ 2.02
PITX2-201ENST00000306732 FMN1Q68DA7 1419 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX2-201ENST00000306732 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.67■■■□□ 2.02
PITX2-201ENST00000306732 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.64■■■□□ 2.02
PITX2-201ENST00000306732 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.64■■■□□ 2.02
PITX2-201ENST00000306732 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
PITX2-201ENST00000306732 NAIPQ13075 1403 aa27.6■■■□□ 2.01
PITX2-201ENST00000306732 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.6■■■□□ 2.01
PITX2-201ENST00000306732 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.58■■■□□ 2.01
PITX2-201ENST00000306732 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PITX2-201ENST00000306732 NCOA2Q15596 1464 aa27.56■■■□□ 2
PITX2-201ENST00000306732 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.55■■■□□ 2
PITX2-201ENST00000306732 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.54■■■□□ 2
PITX2-201ENST00000306732 ERCC6Q03468 1493 aa27.53■■■□□ 2
PITX2-201ENST00000306732 SAMD9Q5K651 1589 aa27.53■■■□□ 2
PITX2-201ENST00000306732 GRIN2BQ13224 1484 aa27.49■■□□□ 1.99
PITX2-201ENST00000306732 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
PITX2-201ENST00000306732 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.45■■□□□ 1.99
PITX2-201ENST00000306732 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PITX2-201ENST00000306732 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.44■■□□□ 1.98
PITX2-201ENST00000306732 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
PITX2-201ENST00000306732 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.42■■□□□ 1.98
PITX2-201ENST00000306732 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.4■■□□□ 1.98
PITX2-201ENST00000306732 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.39■■□□□ 1.98
PITX2-201ENST00000306732 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
PITX2-201ENST00000306732 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PITX2-201ENST00000306732 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.39■■□□□ 1.97
PITX2-201ENST00000306732 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.39■■□□□ 1.97
PITX2-201ENST00000306732 ARHGEF11O15085 1522 aa27.37■■□□□ 1.97
PITX2-201ENST00000306732 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PITX2-201ENST00000306732 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.35■■□□□ 1.97
PITX2-201ENST00000306732 HECW1Q76N89 1606 aa27.34■■□□□ 1.97
PITX2-201ENST00000306732 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.33■■□□□ 1.97
PITX2-201ENST00000306732 KDM6BO15054 1643 aa27.31■■□□□ 1.96
PITX2-201ENST00000306732 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PITX2-201ENST00000306732 MSH5O43196 834 aa27.29■■□□□ 1.96
PITX2-201ENST00000306732 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
PITX2-201ENST00000306732 PBRM1Q86U86 1689 aa27.27■■□□□ 1.96
PITX2-201ENST00000306732 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.26■■□□□ 1.95
PITX2-201ENST00000306732 CCDC184Q52MB2 194 aa27.26■■□□□ 1.95
PITX2-201ENST00000306732 WDR62O43379 1518 aa27.23■■□□□ 1.95
PITX2-201ENST00000306732 AKNAQ7Z591 1439 aa27.23■■□□□ 1.95
PITX2-201ENST00000306732 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.21■■□□□ 1.95
PITX2-201ENST00000306732 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PITX2-201ENST00000306732 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
PITX2-201ENST00000306732 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.2■■□□□ 1.94
PITX2-201ENST00000306732 ADAMTS12P58397 1594 aa27.2■■□□□ 1.94
PITX2-201ENST00000306732 FOXD1Q16676 465 aa27.18■■□□□ 1.94
PITX2-201ENST00000306732 BCL11AQ9H165 835 aa27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms