RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.23■■■■□ 3.39
PKDCC-201ENST00000294964 ANP32EQ9BTT0 268 aa36.23■■■■□ 3.39
PKDCC-201ENST00000294964 KIF27Q86VH2 1401 aa36.19■■■■□ 3.38
PKDCC-201ENST00000294964 IFT140Q96RY7 1462 aa36.16■■■■□ 3.38
PKDCC-201ENST00000294964 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
PKDCC-201ENST00000294964 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
PKDCC-201ENST00000294964 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.09■■■■□ 3.37
PKDCC-201ENST00000294964 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.07■■■■□ 3.37
PKDCC-201ENST00000294964 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa36.06■■■■□ 3.36
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
PKDCC-201ENST00000294964 PRXQ9BXM0 1461 aa36.01■■■■□ 3.35
PKDCC-201ENST00000294964 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.98■■■■□ 3.351e-7■■■■■ 29.7
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PKDCC-201ENST00000294964 IGF1RP08069 1367 aa35.96■■■■□ 3.35
PKDCC-201ENST00000294964 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
PKDCC-201ENST00000294964 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
PKDCC-201ENST00000294964 PBRM1Q86U86 1689 aa35.9■■■■□ 3.34
PKDCC-201ENST00000294964 ARAP1Q96P48 1450 aa35.89■■■■□ 3.34
PKDCC-201ENST00000294964 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.86■■■■□ 3.33
PKDCC-201ENST00000294964 GRIN2BQ13224 1484 aa35.77■■■■□ 3.32
PKDCC-201ENST00000294964 CUL7Q14999 1698 aa35.76■■■■□ 3.31
PKDCC-201ENST00000294964 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.74■■■■□ 3.31
PKDCC-201ENST00000294964 ADAMTS12P58397 1594 aa35.65■■■■□ 3.3
PKDCC-201ENST00000294964 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.61■■■■□ 3.29
PKDCC-201ENST00000294964 ITGAEP38570 1179 aa35.59■■■■□ 3.29
PKDCC-201ENST00000294964 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.56■■■■□ 3.28
PKDCC-201ENST00000294964 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
PKDCC-201ENST00000294964 P3H3Q8IVL6 736 aa35.49■■■■□ 3.27
PKDCC-201ENST00000294964 SYNJ2O15056 1496 aa35.42■■■■□ 3.26
PKDCC-201ENST00000294964 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
PKDCC-201ENST00000294964 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
PKDCC-201ENST00000294964 GRIN2AQ12879 1464 aa35.37■■■■□ 3.25
PKDCC-201ENST00000294964 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.33■■■■□ 3.25
PKDCC-201ENST00000294964 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
PKDCC-201ENST00000294964 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-201ENST00000294964 BCANQ96GW7 911 aa35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-201ENST00000294964 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-201ENST00000294964 FBLN2P98095 1184 aa35.29■■■■□ 3.24
PKDCC-201ENST00000294964 CHD1O14646 1710 aa35.29■■■■□ 3.24
PKDCC-201ENST00000294964 CEP170Q5SW79 1584 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-201ENST00000294964 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
PKDCC-201ENST00000294964 NUP160Q12769 1436 aa35.14■■■■□ 3.22
PKDCC-201ENST00000294964 FKBP8Q14318 412 aa35.12■■■■□ 3.21
PKDCC-201ENST00000294964 TIAM1Q13009 1591 aa35.12■■■■□ 3.21
PKDCC-201ENST00000294964 KCNH8Q96L42 1107 aa35.12■■■■□ 3.21
PKDCC-201ENST00000294964 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
PKDCC-201ENST00000294964 IQGAP2Q13576 1575 aa35.09■■■■□ 3.21
PKDCC-201ENST00000294964 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.09■■■■□ 3.21
PKDCC-201ENST00000294964 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.07■■■■□ 3.2
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.06■■■■□ 3.2
PKDCC-201ENST00000294964 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.04■■■■□ 3.2
PKDCC-201ENST00000294964 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.03■■■■□ 3.2
PKDCC-201ENST00000294964 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
PKDCC-201ENST00000294964 SAMD9Q5K651 1589 aa34.92■■■■□ 3.18
PKDCC-201ENST00000294964 MSH5O43196 834 aa34.91■■■■□ 3.18
PKDCC-201ENST00000294964 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.9■■■■□ 3.18
PKDCC-201ENST00000294964 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.9■■■■□ 3.18
PKDCC-201ENST00000294964 MAP3K1Q13233 1512 aa34.87■■■■□ 3.17
PKDCC-201ENST00000294964 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.85■■■■□ 3.17
PKDCC-201ENST00000294964 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
PKDCC-201ENST00000294964 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.84■■■■□ 3.17
PKDCC-201ENST00000294964 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.81■■■■□ 3.16
PKDCC-201ENST00000294964 DISP1Q96F81 1524 aa34.8■■■■□ 3.16
PKDCC-201ENST00000294964 MAPKBP1O60336 1514 aa34.79■■■■□ 3.16
PKDCC-201ENST00000294964 NEFLP07196 543 aa34.79■■■■□ 3.16
PKDCC-201ENST00000294964 JPH4Q96JJ6 628 aa34.79■■■■□ 3.16
PKDCC-201ENST00000294964 SHROOM2Q13796 1616 aa34.77■■■■□ 3.16
PKDCC-201ENST00000294964 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.76■■■■□ 3.16
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA0556O60303 1618 aa34.76■■■■□ 3.16
PKDCC-201ENST00000294964 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.69■■■■□ 3.14
PKDCC-201ENST00000294964 OSCARQ8IYS5 282 aa34.67■■■■□ 3.14
PKDCC-201ENST00000294964 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.67■■■■□ 3.14
PKDCC-201ENST00000294964 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
PKDCC-201ENST00000294964 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.61■■■■□ 3.13
PKDCC-201ENST00000294964 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.59■■■■□ 3.13
PKDCC-201ENST00000294964 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.59■■■■□ 3.13
PKDCC-201ENST00000294964 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.13
PKDCC-201ENST00000294964 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.57■■■■□ 3.12
PKDCC-201ENST00000294964 FMN1Q68DA7 1419 aa34.56■■■■□ 3.12
PKDCC-201ENST00000294964 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
PKDCC-201ENST00000294964 ERICH6Q7L0X2 663 aa34.52■■■■□ 3.12
PKDCC-201ENST00000294964 ARID3CA6NKF2 412 aa34.51■■■■□ 3.12
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM52Q96A61 297 aa34.49■■■■□ 3.11
PKDCC-201ENST00000294964 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.48■■■■□ 3.11
PKDCC-201ENST00000294964 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.47■■■■□ 3.11
PKDCC-201ENST00000294964 PTPRKQ15262 1439 aa34.44■■■■□ 3.1
PKDCC-201ENST00000294964 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.36■■■■□ 3.09
PKDCC-201ENST00000294964 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
PKDCC-201ENST00000294964 NCOA2Q15596 1464 aa34.35■■■■□ 3.09
PKDCC-201ENST00000294964 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.34■■■■□ 3.09
PKDCC-201ENST00000294964 PTPRGP23470 1445 aa34.34■■■■□ 3.09
PKDCC-201ENST00000294964 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-201ENST00000294964 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.33■■■■□ 3.09
PKDCC-201ENST00000294964 CCER2I3L3R5 266 aa34.32■■■■□ 3.08
PKDCC-201ENST00000294964 DEKP35659 375 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-201ENST00000294964 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-201ENST00000294964 HECW1Q76N89 1606 aa34.31■■■■□ 3.08
PKDCC-201ENST00000294964 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.29■■■■□ 3.08
PKDCC-201ENST00000294964 ABCA8O94911 1581 aa34.29■■■■□ 3.08
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