RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271636.11

CGN-201, Transcript of cingulin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGN, Length 5,091 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGN-201ENST00000271636 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CGN-201ENST00000271636 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CGN-201ENST00000271636 IGF1RP08069 1367 aa20.91■□□□□ 0.94
CGN-201ENST00000271636 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.91■□□□□ 0.94
CGN-201ENST00000271636 ANP32CO43423 234 aa20.9■□□□□ 0.94
CGN-201ENST00000271636 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.9■□□□□ 0.94
CGN-201ENST00000271636 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.88■□□□□ 0.93
CGN-201ENST00000271636 CUX1P39880 1505 aa20.87■□□□□ 0.93
CGN-201ENST00000271636 TSPY4P0CV99 314 aa20.85■□□□□ 0.93
CGN-201ENST00000271636 TSPY10P0CW01 314 aa20.85■□□□□ 0.93
CGN-201ENST00000271636 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.83■□□□□ 0.92
CGN-201ENST00000271636 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.82■□□□□ 0.92
CGN-201ENST00000271636 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.82■□□□□ 0.92
CGN-201ENST00000271636 PRXQ9BXM0 1461 aa20.82■□□□□ 0.92
CGN-201ENST00000271636 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CGN-201ENST00000271636 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
CGN-201ENST00000271636 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.79■□□□□ 0.92
CGN-201ENST00000271636 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.77■□□□□ 0.92
CGN-201ENST00000271636 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.76■□□□□ 0.91
CGN-201ENST00000271636 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.76■□□□□ 0.91
CGN-201ENST00000271636 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.75■□□□□ 0.91
CGN-201ENST00000271636 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.75■□□□□ 0.91
CGN-201ENST00000271636 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CGN-201ENST00000271636 TOPBP1Q92547 1522 aa20.74■□□□□ 0.91
CGN-201ENST00000271636 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CGN-201ENST00000271636 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.73■□□□□ 0.91
CGN-201ENST00000271636 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.7■□□□□ 0.9
CGN-201ENST00000271636 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.67■□□□□ 0.9
CGN-201ENST00000271636 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CGN-201ENST00000271636 NESP48681 1621 aa20.66■□□□□ 0.9
CGN-201ENST00000271636 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.65■□□□□ 0.9
CGN-201ENST00000271636 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CGN-201ENST00000271636 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.62■□□□□ 0.89
CGN-201ENST00000271636 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.62■□□□□ 0.89
CGN-201ENST00000271636 GRIN2BQ13224 1484 aa20.6■□□□□ 0.89
CGN-201ENST00000271636 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CGN-201ENST00000271636 IFT140Q96RY7 1462 aa20.58■□□□□ 0.89
CGN-201ENST00000271636 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.57■□□□□ 0.88
CGN-201ENST00000271636 ARAP1Q96P48 1450 aa20.56■□□□□ 0.88
CGN-201ENST00000271636 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.56■□□□□ 0.88
CGN-201ENST00000271636 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.55■□□□□ 0.88
CGN-201ENST00000271636 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.55■□□□□ 0.88
CGN-201ENST00000271636 CUL7Q14999 1698 aa20.54■□□□□ 0.88
CGN-201ENST00000271636 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
CGN-201ENST00000271636 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CGN-201ENST00000271636 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CGN-201ENST00000271636 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.51■□□□□ 0.87
CGN-201ENST00000271636 KCNH8Q96L42 1107 aa20.49■□□□□ 0.87
CGN-201ENST00000271636 JPH4Q96JJ6 628 aa20.48■□□□□ 0.87
CGN-201ENST00000271636 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
CGN-201ENST00000271636 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
CGN-201ENST00000271636 MIER1Q8N108 512 aa20.44■□□□□ 0.86
CGN-201ENST00000271636 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CGN-201ENST00000271636 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CGN-201ENST00000271636 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.42■□□□□ 0.86
CGN-201ENST00000271636 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.39■□□□□ 0.85
CGN-201ENST00000271636 TIAM1Q13009 1591 aa20.38■□□□□ 0.85
CGN-201ENST00000271636 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.37■□□□□ 0.85
CGN-201ENST00000271636 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.37■□□□□ 0.85
CGN-201ENST00000271636 MAP3K1Q13233 1512 aa20.37■□□□□ 0.85
CGN-201ENST00000271636 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.37■□□□□ 0.85
CGN-201ENST00000271636 PRDM2Q13029 1718 aa20.36■□□□□ 0.85
CGN-201ENST00000271636 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CGN-201ENST00000271636 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.32■□□□□ 0.84
CGN-201ENST00000271636 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.32■□□□□ 0.84
CGN-201ENST00000271636 PTPRGP23470 1445 aa20.32■□□□□ 0.84
CGN-201ENST00000271636 HECW1Q76N89 1606 aa20.3■□□□□ 0.84
CGN-201ENST00000271636 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.29■□□□□ 0.84
CGN-201ENST00000271636 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CGN-201ENST00000271636 NCOA2Q15596 1464 aa20.29■□□□□ 0.84
CGN-201ENST00000271636 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.27■□□□□ 0.84
CGN-201ENST00000271636 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.26■□□□□ 0.83
CGN-201ENST00000271636 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.26■□□□□ 0.83
CGN-201ENST00000271636 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
CGN-201ENST00000271636 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.25■□□□□ 0.83
CGN-201ENST00000271636 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CGN-201ENST00000271636 IQGAP2Q13576 1575 aa20.25■□□□□ 0.83
CGN-201ENST00000271636 KANK1Q14678 1352 aa20.23■□□□□ 0.83
CGN-201ENST00000271636 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CGN-201ENST00000271636 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
CGN-201ENST00000271636 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CGN-201ENST00000271636 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 MIA2Q96PC5 1412 aa20.19■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.18■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.18■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 PKD2Q13563 968 aa20.17■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 CDCA8Q53HL2 280 aa20.17■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 MRS2Q9HD23 443 aa20.17■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 UACAQ9BZF9 1416 aa20.17■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 NUP155O75694 1391 aa20.16■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 TMC1Q8TDI8 760 aa20.16■□□□□ 0.82
CGN-201ENST00000271636 SYNJ2O15056 1496 aa20.14■□□□□ 0.81
CGN-201ENST00000271636 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.13■□□□□ 0.81
CGN-201ENST00000271636 SLC24A1O60721 1099 aa20.12■□□□□ 0.81
CGN-201ENST00000271636 CCER2I3L3R5 266 aa20.12■□□□□ 0.81
CGN-201ENST00000271636 RGL3Q3MIN7 710 aa20.12■□□□□ 0.81
CGN-201ENST00000271636 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CGN-201ENST00000271636 GRIN2AQ12879 1464 aa20.1■□□□□ 0.81
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