RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270176.9

SCYL1-201, Transcript of SCY1 like pseudokinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCYL1, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL1-201ENST00000270176 MIER1Q8N108 512 aa22.28■■□□□ 1.16
SCYL1-201ENST00000270176 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.24■■□□□ 1.15
SCYL1-201ENST00000270176 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.21■■□□□ 1.15
SCYL1-201ENST00000270176 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.19■■□□□ 1.14
SCYL1-201ENST00000270176 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.17■■□□□ 1.14
SCYL1-201ENST00000270176 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.16■■□□□ 1.14
SCYL1-201ENST00000270176 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.14■■□□□ 1.13
SCYL1-201ENST00000270176 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SCYL1-201ENST00000270176 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.13■■□□□ 1.13
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SCYL1-201ENST00000270176 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SCYL1-201ENST00000270176 TIAM1Q13009 1591 aa22.11■■□□□ 1.13
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SCYL1-201ENST00000270176 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.08■■□□□ 1.12
SCYL1-201ENST00000270176 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.07■■□□□ 1.12
SCYL1-201ENST00000270176 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.06■■□□□ 1.12
SCYL1-201ENST00000270176 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.04■■□□□ 1.12
SCYL1-201ENST00000270176 WDR97A6NE52 1622 aa22.02■■□□□ 1.11
SCYL1-201ENST00000270176 CUL7Q14999 1698 aa22.01■■□□□ 1.11
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SCYL1-201ENST00000270176 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.96■■□□□ 1.11
SCYL1-201ENST00000270176 ARID3CA6NKF2 412 aa21.95■■□□□ 1.1
SCYL1-201ENST00000270176 MAP3K1Q13233 1512 aa21.91■■□□□ 1.1
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SCYL1-201ENST00000270176 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.84■■□□□ 1.09
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SCYL1-201ENST00000270176 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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SCYL1-201ENST00000270176 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.82■■□□□ 1.08
SCYL1-201ENST00000270176 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.81■■□□□ 1.08
SCYL1-201ENST00000270176 SAMD9Q5K651 1589 aa21.77■■□□□ 1.08
SCYL1-201ENST00000270176 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.77■■□□□ 1.08
SCYL1-201ENST00000270176 PBRM1Q86U86 1689 aa21.76■■□□□ 1.07
SCYL1-201ENST00000270176 MAPKBP1O60336 1514 aa21.75■■□□□ 1.07
SCYL1-201ENST00000270176 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.72■■□□□ 1.07
SCYL1-201ENST00000270176 GRIN2BQ13224 1484 aa21.71■■□□□ 1.07
SCYL1-201ENST00000270176 FBLN2P98095 1184 aa21.69■■□□□ 1.06
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SCYL1-201ENST00000270176 ERCC6Q03468 1493 aa21.68■■□□□ 1.06
SCYL1-201ENST00000270176 NCOA2Q15596 1464 aa21.68■■□□□ 1.06
SCYL1-201ENST00000270176 ADAMTS12P58397 1594 aa21.68■■□□□ 1.06
SCYL1-201ENST00000270176 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.67■■□□□ 1.06
SCYL1-201ENST00000270176 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.66■■□□□ 1.06
SCYL1-201ENST00000270176 IQGAP2Q13576 1575 aa21.65■■□□□ 1.06
SCYL1-201ENST00000270176 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SCYL1-201ENST00000270176 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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SCYL1-201ENST00000270176 IFT140Q96RY7 1462 aa21.61■■□□□ 1.05
SCYL1-201ENST00000270176 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.59■■□□□ 1.05
SCYL1-201ENST00000270176 WDR62O43379 1518 aa21.59■■□□□ 1.05
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SCYL1-201ENST00000270176 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SCYL1-201ENST00000270176 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SCYL1-201ENST00000270176 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.53■■□□□ 1.04
SCYL1-201ENST00000270176 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.53■■□□□ 1.04
SCYL1-201ENST00000270176 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
SCYL1-201ENST00000270176 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.5■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 HECW1Q76N89 1606 aa21.49■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.49■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 KCNH8Q96L42 1107 aa21.49■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 GRIN2AQ12879 1464 aa21.48■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.48■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 NAIPQ13075 1403 aa21.48■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 DISP1Q96F81 1524 aa21.47■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 HFM1A2PYH4 1435 aa21.47■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 TRIM52Q96A61 297 aa21.46■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.46■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SCYL1-201ENST00000270176 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SCYL1-201ENST00000270176 ARHGEF11O15085 1522 aa21.42■■□□□ 1.02
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SCYL1-201ENST00000270176 KIAA0556O60303 1618 aa21.41■■□□□ 1.02
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SCYL1-201ENST00000270176 TONSLQ96HA7 1378 aa21.39■■□□□ 1.01
SCYL1-201ENST00000270176 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SCYL1-201ENST00000270176 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.38■■□□□ 1.01
SCYL1-201ENST00000270176 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.37■■□□□ 1.01
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SCYL1-201ENST00000270176 KDM6BO15054 1643 aa21.36■■□□□ 1.01
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SCYL1-201ENST00000270176 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SCYL1-201ENST00000270176 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SCYL1-201ENST00000270176 SYNJ2O15056 1496 aa21.33■■□□□ 1
SCYL1-201ENST00000270176 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SCYL1-201ENST00000270176 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SCYL1-201ENST00000270176 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.3■■□□□ 1
SCYL1-201ENST00000270176 CCER2I3L3R5 266 aa21.29■■□□□ 1
SCYL1-201ENST00000270176 ANP32CO43423 234 aa21.28■■□□□ 1
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