RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269385.8

CBX8-201, Transcript of chromobox 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX8, Length 3,791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8-201ENST00000269385 ITGAEP38570 1179 aa23.1■■□□□ 1.29
CBX8-201ENST00000269385 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.09■■□□□ 1.29
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CBX8-201ENST00000269385 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
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CBX8-201ENST00000269385 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23■■□□□ 1.27
CBX8-201ENST00000269385 KIF27Q86VH2 1401 aa22.97■■□□□ 1.27
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CBX8-201ENST00000269385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.83■■□□□ 1.25
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CBX8-201ENST00000269385 TIAM1Q13009 1591 aa22.74■■□□□ 1.23
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CBX8-201ENST00000269385 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.63■■□□□ 1.21
CBX8-201ENST00000269385 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.59■■□□□ 1.21
CBX8-201ENST00000269385 PBRM1Q86U86 1689 aa22.57■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.56■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.54■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.53■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 TRIM52Q96A61 297 aa22.52■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.52■■□□□ 1.2
CBX8-201ENST00000269385 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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CBX8-201ENST00000269385 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.36■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.36■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 GRIN2BQ13224 1484 aa22.36■■□□□ 1.17
CBX8-201ENST00000269385 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.36■■□□□ 1.17
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CBX8-201ENST00000269385 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.29■■□□□ 1.16
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CBX8-201ENST00000269385 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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CBX8-201ENST00000269385 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.16■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 ANP32CO43423 234 aa22.16■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.15■■□□□ 1.14
CBX8-201ENST00000269385 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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CBX8-201ENST00000269385 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 FMN1Q68DA7 1419 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CBX8-201ENST00000269385 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.07■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CBX8-201ENST00000269385 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.07■■□□□ 1.12
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