RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.71■■□□□ 1.87
PRDM12-201ENST00000253008 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.7■■□□□ 1.87
PRDM12-201ENST00000253008 NESP48681 1621 aa26.69■■□□□ 1.86
PRDM12-201ENST00000253008 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.66■■□□□ 1.86
PRDM12-201ENST00000253008 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PRDM12-201ENST00000253008 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.63■■□□□ 1.85
PRDM12-201ENST00000253008 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PRDM12-201ENST00000253008 MAPKBP1O60336 1514 aa26.58■■□□□ 1.85
PRDM12-201ENST00000253008 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PRDM12-201ENST00000253008 MAP3K1Q13233 1512 aa26.57■■□□□ 1.84
PRDM12-201ENST00000253008 TOPBP1Q92547 1522 aa26.57■■□□□ 1.84
PRDM12-201ENST00000253008 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.55■■□□□ 1.84
PRDM12-201ENST00000253008 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM12-201ENST00000253008 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM12-201ENST00000253008 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.53■■□□□ 1.84
PRDM12-201ENST00000253008 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.52■■□□□ 1.84
PRDM12-201ENST00000253008 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.44■■□□□ 1.82
PRDM12-201ENST00000253008 KCNH8Q96L42 1107 aa26.43■■□□□ 1.82
PRDM12-201ENST00000253008 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PRDM12-201ENST00000253008 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.41■■□□□ 1.82
PRDM12-201ENST00000253008 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PRDM12-201ENST00000253008 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.37■■□□□ 1.81
PRDM12-201ENST00000253008 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.36■■□□□ 1.81
PRDM12-201ENST00000253008 WDR97A6NE52 1622 aa26.35■■□□□ 1.81
PRDM12-201ENST00000253008 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PRDM12-201ENST00000253008 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.31■■□□□ 1.8
PRDM12-201ENST00000253008 CUL7Q14999 1698 aa26.3■■□□□ 1.8
PRDM12-201ENST00000253008 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.28■■□□□ 1.8
PRDM12-201ENST00000253008 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PRDM12-201ENST00000253008 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.27■■□□□ 1.8
PRDM12-201ENST00000253008 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
PRDM12-201ENST00000253008 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.26■■□□□ 1.79
PRDM12-201ENST00000253008 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.25■■□□□ 1.79
PRDM12-201ENST00000253008 PTPRKQ15262 1439 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM12-201ENST00000253008 FMN1Q68DA7 1419 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM12-201ENST00000253008 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM12-201ENST00000253008 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.23■■□□□ 1.79
PRDM12-201ENST00000253008 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM12-201ENST00000253008 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PRDM12-201ENST00000253008 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.17■■□□□ 1.78
PRDM12-201ENST00000253008 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PRDM12-201ENST00000253008 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.16■■□□□ 1.78
PRDM12-201ENST00000253008 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
PRDM12-201ENST00000253008 SAMD9Q5K651 1589 aa26.11■■□□□ 1.77
PRDM12-201ENST00000253008 NCOA2Q15596 1464 aa26.11■■□□□ 1.77
PRDM12-201ENST00000253008 GRIN2BQ13224 1484 aa26.1■■□□□ 1.77
PRDM12-201ENST00000253008 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.09■■□□□ 1.77
PRDM12-201ENST00000253008 ARID3CA6NKF2 412 aa26.08■■□□□ 1.77
PRDM12-201ENST00000253008 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.05■■□□□ 1.76
PRDM12-201ENST00000253008 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.05■■□□□ 1.76
PRDM12-201ENST00000253008 HFM1A2PYH4 1435 aa26.04■■□□□ 1.76
PRDM12-201ENST00000253008 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.04■■□□□ 1.76
PRDM12-201ENST00000253008 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.04■■□□□ 1.76
PRDM12-201ENST00000253008 NAIPQ13075 1403 aa26.03■■□□□ 1.76
PRDM12-201ENST00000253008 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.02■■□□□ 1.76
PRDM12-201ENST00000253008 TONSLQ96HA7 1378 aa26.01■■□□□ 1.75
PRDM12-201ENST00000253008 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.01■■□□□ 1.75
PRDM12-201ENST00000253008 UACAQ9BZF9 1416 aa25.99■■□□□ 1.75
PRDM12-201ENST00000253008 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PRDM12-201ENST00000253008 MYT1Q01538 1121 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM12-201ENST00000253008 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PRDM12-201ENST00000253008 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.92■■□□□ 1.74
PRDM12-201ENST00000253008 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.92■■□□□ 1.74
PRDM12-201ENST00000253008 BCANQ96GW7 911 aa25.89■■□□□ 1.73
PRDM12-201ENST00000253008 TRIM52Q96A61 297 aa25.88■■□□□ 1.73
PRDM12-201ENST00000253008 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.88■■□□□ 1.73
PRDM12-201ENST00000253008 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PRDM12-201ENST00000253008 ARHGEF11O15085 1522 aa25.87■■□□□ 1.73
PRDM12-201ENST00000253008 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PRDM12-201ENST00000253008 ANP32CO43423 234 aa25.85■■□□□ 1.73
PRDM12-201ENST00000253008 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.83■■□□□ 1.73
PRDM12-201ENST00000253008 FOXD1Q16676 465 aa25.83■■□□□ 1.73
PRDM12-201ENST00000253008 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PRDM12-201ENST00000253008 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PRDM12-201ENST00000253008 KDM6BO15054 1643 aa25.82■■□□□ 1.72
PRDM12-201ENST00000253008 PBRM1Q86U86 1689 aa25.81■■□□□ 1.72
PRDM12-201ENST00000253008 IQGAP2Q13576 1575 aa25.81■■□□□ 1.72
PRDM12-201ENST00000253008 FKBP8Q14318 412 aa25.78■■□□□ 1.72
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PRDM12-201ENST00000253008 ADAMTS12P58397 1594 aa25.76■■□□□ 1.71
PRDM12-201ENST00000253008 HECW1Q76N89 1606 aa25.76■■□□□ 1.71
PRDM12-201ENST00000253008 CCER2I3L3R5 266 aa25.76■■□□□ 1.71
PRDM12-201ENST00000253008 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRDM12-201ENST00000253008 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.74■■□□□ 1.71
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PRDM12-201ENST00000253008 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.72■■□□□ 1.71
PRDM12-201ENST00000253008 WDR62O43379 1518 aa25.71■■□□□ 1.71
PRDM12-201ENST00000253008 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PRDM12-201ENST00000253008 ERCC6Q03468 1493 aa25.7■■□□□ 1.7
PRDM12-201ENST00000253008 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.67■■□□□ 1.7
PRDM12-201ENST00000253008 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.66■■□□□ 1.7
PRDM12-201ENST00000253008 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.65■■□□□ 1.7
PRDM12-201ENST00000253008 MIA2Q96PC5 1412 aa25.63■■□□□ 1.69
PRDM12-201ENST00000253008 IFT140Q96RY7 1462 aa25.63■■□□□ 1.69
PRDM12-201ENST00000253008 DISP1Q96F81 1524 aa25.61■■□□□ 1.69
PRDM12-201ENST00000253008 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PRDM12-201ENST00000253008 AKNAQ7Z591 1439 aa25.58■■□□□ 1.68
PRDM12-201ENST00000253008 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PRDM12-201ENST00000253008 DAPK1P53355 1430 aa25.57■■□□□ 1.68
PRDM12-201ENST00000253008 ABCC5O15440 1437 aa25.56■■□□□ 1.68
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