RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.03■■■□□ 2.72
HTATSF1-201ENST00000218364 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32■■■□□ 2.71
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGAEP38570 1179 aa31.99■■■□□ 2.71
HTATSF1-201ENST00000218364 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.98■■■□□ 2.71
HTATSF1-201ENST00000218364 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.94■■■□□ 2.7
HTATSF1-201ENST00000218364 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.92■■■□□ 2.7
HTATSF1-201ENST00000218364 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.92■■■□□ 2.7
HTATSF1-201ENST00000218364 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.92■■■□□ 2.7
HTATSF1-201ENST00000218364 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
HTATSF1-201ENST00000218364 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.88■■■□□ 2.69
HTATSF1-201ENST00000218364 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
HTATSF1-201ENST00000218364 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.77■■■□□ 2.68
HTATSF1-201ENST00000218364 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.75■■■□□ 2.67
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR97A6NE52 1622 aa31.74■■■□□ 2.67
HTATSF1-201ENST00000218364 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.73■■■□□ 2.67
HTATSF1-201ENST00000218364 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.73■■■□□ 2.67
HTATSF1-201ENST00000218364 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.672e-8■■■■■ 35.8
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1-201ENST00000218364 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.68■■■□□ 2.66
HTATSF1-201ENST00000218364 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.67■■■□□ 2.66
HTATSF1-201ENST00000218364 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.66■■■□□ 2.66
HTATSF1-201ENST00000218364 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.65■■■□□ 2.66
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNH8Q96L42 1107 aa31.62■■■□□ 2.65
HTATSF1-201ENST00000218364 P3H3Q8IVL6 736 aa31.62■■■□□ 2.65
HTATSF1-201ENST00000218364 CUL7Q14999 1698 aa31.6■■■□□ 2.65
HTATSF1-201ENST00000218364 ERCC6Q03468 1493 aa31.59■■■□□ 2.65
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.65
HTATSF1-201ENST00000218364 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
HTATSF1-201ENST00000218364 TOPBP1Q92547 1522 aa31.56■■■□□ 2.64
HTATSF1-201ENST00000218364 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.55■■■□□ 2.64
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
HTATSF1-201ENST00000218364 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.64
HTATSF1-201ENST00000218364 FMN1Q68DA7 1419 aa31.51■■■□□ 2.63
HTATSF1-201ENST00000218364 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.49■■■□□ 2.63
HTATSF1-201ENST00000218364 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.47■■■□□ 2.63
HTATSF1-201ENST00000218364 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.46■■■□□ 2.63
HTATSF1-201ENST00000218364 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa31.45■■■□□ 2.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CCER2I3L3R5 266 aa31.43■■■□□ 2.62
HTATSF1-201ENST00000218364 HFM1A2PYH4 1435 aa31.4■■■□□ 2.62
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.38■■■□□ 2.61
HTATSF1-201ENST00000218364 UACAQ9BZF9 1416 aa31.37■■■□□ 2.61
HTATSF1-201ENST00000218364 SAMD9Q5K651 1589 aa31.36■■■□□ 2.61
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.33■■■□□ 2.61
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPRKQ15262 1439 aa31.33■■■□□ 2.61
HTATSF1-201ENST00000218364 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.32■■■□□ 2.6
HTATSF1-201ENST00000218364 TONSLQ96HA7 1378 aa31.31■■■□□ 2.6
HTATSF1-201ENST00000218364 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
HTATSF1-201ENST00000218364 ANP32CO43423 234 aa31.29■■■□□ 2.6
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR62O43379 1518 aa31.29■■■□□ 2.6
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIN2BQ13224 1484 aa31.28■■■□□ 2.6
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.27■■■□□ 2.6
HTATSF1-201ENST00000218364 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.26■■■□□ 2.6
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.26■■■□□ 2.6
HTATSF1-201ENST00000218364 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
HTATSF1-201ENST00000218364 NCOA2Q15596 1464 aa31.26■■■□□ 2.59
HTATSF1-201ENST00000218364 NAIPQ13075 1403 aa31.26■■■□□ 2.59
HTATSF1-201ENST00000218364 FKBP8Q14318 412 aa31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1-201ENST00000218364 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1-201ENST00000218364 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1-201ENST00000218364 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.17■■■□□ 2.58
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGEF11O15085 1522 aa31.16■■■□□ 2.58
HTATSF1-201ENST00000218364 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.15■■■□□ 2.58
HTATSF1-201ENST00000218364 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1-201ENST00000218364 BCANQ96GW7 911 aa31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1-201ENST00000218364 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
HTATSF1-201ENST00000218364 NEFLP07196 543 aa31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM52Q96A61 297 aa31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-201ENST00000218364 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-201ENST00000218364 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1-201ENST00000218364 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1-201ENST00000218364 AKNAQ7Z591 1439 aa31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1-201ENST00000218364 IFT140Q96RY7 1462 aa31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1-201ENST00000218364 ANP32EQ9BTT0 268 aa31■■■□□ 2.55
HTATSF1-201ENST00000218364 HECW1Q76N89 1606 aa31■■■□□ 2.55
HTATSF1-201ENST00000218364 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
HTATSF1-201ENST00000218364 MIA2Q96PC5 1412 aa30.89■■■□□ 2.54
HTATSF1-201ENST00000218364 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1-201ENST00000218364 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1-201ENST00000218364 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1-201ENST00000218364 KDM6BO15054 1643 aa30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
HTATSF1-201ENST00000218364 IQGAP2Q13576 1575 aa30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1-201ENST00000218364 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.79■■■□□ 2.524e-7■□□□□ 10.8
HTATSF1-201ENST00000218364 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.77■■■□□ 2.52
HTATSF1-201ENST00000218364 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.77■■■□□ 2.52
HTATSF1-201ENST00000218364 PBRM1Q86U86 1689 aa30.77■■■□□ 2.52
HTATSF1-201ENST00000218364 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.76■■■□□ 2.51
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMTS12P58397 1594 aa30.73■■■□□ 2.51
HTATSF1-201ENST00000218364 ROCK1Q13464 1354 aa30.71■■■□□ 2.51
HTATSF1-201ENST00000218364 NCOA1Q15788 1441 aa30.7■■■□□ 2.5
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