RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 ARAP1Q96P48 1450 aa33.33■■■□□ 2.93
ANKRD54-201ENST00000215941 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.27■■■□□ 2.92
ANKRD54-201ENST00000215941 WDR97A6NE52 1622 aa33.18■■■□□ 2.9
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.18■■■□□ 2.9
ANKRD54-201ENST00000215941 CUL7Q14999 1698 aa33.11■■■□□ 2.89
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.03■■■□□ 2.88
ANKRD54-201ENST00000215941 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
ANKRD54-201ENST00000215941 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.01■■■□□ 2.87
ANKRD54-201ENST00000215941 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
ANKRD54-201ENST00000215941 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
ANKRD54-201ENST00000215941 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.96■■■□□ 2.87
ANKRD54-201ENST00000215941 MAP3K1Q13233 1512 aa32.96■■■□□ 2.87
ANKRD54-201ENST00000215941 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
ANKRD54-201ENST00000215941 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.93■■■□□ 2.86
ANKRD54-201ENST00000215941 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.89■■■□□ 2.86
ANKRD54-201ENST00000215941 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.79■■■□□ 2.84
ANKRD54-201ENST00000215941 MAPKBP1O60336 1514 aa32.77■■■□□ 2.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TIAM1Q13009 1591 aa32.77■■■□□ 2.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.77■■■□□ 2.84
ANKRD54-201ENST00000215941 P3H3Q8IVL6 736 aa32.75■■■□□ 2.83
ANKRD54-201ENST00000215941 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.72■■■□□ 2.83
ANKRD54-201ENST00000215941 PBRM1Q86U86 1689 aa32.72■■■□□ 2.83
ANKRD54-201ENST00000215941 WDR62O43379 1518 aa32.7■■■□□ 2.83
ANKRD54-201ENST00000215941 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.7■■■□□ 2.82
ANKRD54-201ENST00000215941 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
ANKRD54-201ENST00000215941 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.66■■■□□ 2.82
ANKRD54-201ENST00000215941 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.66■■■□□ 2.82
ANKRD54-201ENST00000215941 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.65■■■□□ 2.82
ANKRD54-201ENST00000215941 IFT140Q96RY7 1462 aa32.63■■■□□ 2.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa32.62■■■□□ 2.81
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.59■■■□□ 2.81
ANKRD54-201ENST00000215941 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.59■■■□□ 2.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ERCC6Q03468 1493 aa32.59■■■□□ 2.81
ANKRD54-201ENST00000215941 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.57■■■□□ 2.8
ANKRD54-201ENST00000215941 GRIN2BQ13224 1484 aa32.57■■■□□ 2.8
ANKRD54-201ENST00000215941 SAMD9Q5K651 1589 aa32.56■■■□□ 2.8
ANKRD54-201ENST00000215941 ADAMTS12P58397 1594 aa32.56■■■□□ 2.8
ANKRD54-201ENST00000215941 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.55■■■□□ 2.8
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
ANKRD54-201ENST00000215941 FMN1Q68DA7 1419 aa32.53■■■□□ 2.8
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.8
ANKRD54-201ENST00000215941 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
ANKRD54-201ENST00000215941 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.45■■■□□ 2.79
ANKRD54-201ENST00000215941 ITGAEP38570 1179 aa32.45■■■□□ 2.78
ANKRD54-201ENST00000215941 ANP32EQ9BTT0 268 aa32.42■■■□□ 2.78
ANKRD54-201ENST00000215941 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.42■■■□□ 2.78
ANKRD54-201ENST00000215941 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.41■■■□□ 2.78
ANKRD54-201ENST00000215941 CCER2I3L3R5 266 aa32.39■■■□□ 2.78
ANKRD54-201ENST00000215941 IQGAP2Q13576 1575 aa32.38■■■□□ 2.77
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNH8Q96L42 1107 aa32.34■■■□□ 2.77
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.26■■■□□ 2.75
ANKRD54-201ENST00000215941 NEFLP07196 543 aa32.22■■■□□ 2.75
ANKRD54-201ENST00000215941 FKBP8Q14318 412 aa32.22■■■□□ 2.75
ANKRD54-201ENST00000215941 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.21■■■□□ 2.75
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
ANKRD54-201ENST00000215941 GRIN2AQ12879 1464 aa32.2■■■□□ 2.74
ANKRD54-201ENST00000215941 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.2■■■□□ 2.74
ANKRD54-201ENST00000215941 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.19■■■□□ 2.74
ANKRD54-201ENST00000215941 ANP32CO43423 234 aa32.18■■■□□ 2.74
ANKRD54-201ENST00000215941 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.18■■■□□ 2.74
ANKRD54-201ENST00000215941 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
ANKRD54-201ENST00000215941 HECW1Q76N89 1606 aa32.11■■■□□ 2.73
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.11■■■□□ 2.73
ANKRD54-201ENST00000215941 SYNJ2O15056 1496 aa32.08■■■□□ 2.73
ANKRD54-201ENST00000215941 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.07■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.05■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 KIAA0556O60303 1618 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 UACAQ9BZF9 1416 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 BCANQ96GW7 911 aa32.04■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 NCOA2Q15596 1464 aa32.03■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 TONSLQ96HA7 1378 aa32.03■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 HFM1A2PYH4 1435 aa32.03■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 DISP1Q96F81 1524 aa32.02■■■□□ 2.72
ANKRD54-201ENST00000215941 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
ANKRD54-201ENST00000215941 CEP170Q5SW79 1584 aa31.99■■■□□ 2.71
ANKRD54-201ENST00000215941 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.98■■■□□ 2.71
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.97■■■□□ 2.71
ANKRD54-201ENST00000215941 FBLN2P98095 1184 aa31.96■■■□□ 2.71
ANKRD54-201ENST00000215941 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
ANKRD54-201ENST00000215941 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.95■■■□□ 2.7
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGEF11O15085 1522 aa31.91■■■□□ 2.7
ANKRD54-201ENST00000215941 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
ANKRD54-201ENST00000215941 NUP160Q12769 1436 aa31.88■■■□□ 2.69
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM52Q96A61 297 aa31.88■■■□□ 2.69
ANKRD54-201ENST00000215941 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.84■■■□□ 2.69
ANKRD54-201ENST00000215941 ARID3CA6NKF2 412 aa31.82■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.81■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 NAIPQ13075 1403 aa31.81■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 ERICH6BQ5W0A0 696 aa31.8■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPRKQ15262 1439 aa31.77■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.76■■■□□ 2.68
ANKRD54-201ENST00000215941 JPH4Q96JJ6 628 aa31.76■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms