RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.68□□□□□ -0.38
RRN3-201ENST00000198767 TOP2BQ02880 1626 aa12.65□□□□□ -0.39
RRN3-201ENST00000198767 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.65□□□□□ -0.39
RRN3-201ENST00000198767 FKBP8Q14318 412 aa12.64□□□□□ -0.39
RRN3-201ENST00000198767 BCL11AQ9H165 835 aa12.63□□□□□ -0.39
RRN3-201ENST00000198767 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
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RRN3-201ENST00000198767 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.61□□□□□ -0.39
RRN3-201ENST00000198767 TRIM52Q96A61 297 aa12.6□□□□□ -0.39
RRN3-201ENST00000198767 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.59□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 30
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RRN3-201ENST00000198767 PRXQ9BXM0 1461 aa12.57□□□□□ -0.4
RRN3-201ENST00000198767 TOPBP1Q92547 1522 aa12.56□□□□□ -0.4
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RRN3-201ENST00000198767 KIF21BO75037 1637 aa12.55□□□□□ -0.4
RRN3-201ENST00000198767 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
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RRN3-201ENST00000198767 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
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RRN3-201ENST00000198767 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.5□□□□□ -0.41
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RRN3-201ENST00000198767 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.49□□□□□ -0.41
RRN3-201ENST00000198767 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
RRN3-201ENST00000198767 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.48□□□□□ -0.41
RRN3-201ENST00000198767 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
RRN3-201ENST00000198767 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.44□□□□□ -0.42
RRN3-201ENST00000198767 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.44□□□□□ -0.42
RRN3-201ENST00000198767 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.44□□□□□ -0.42
RRN3-201ENST00000198767 NEFLP07196 543 aa12.43□□□□□ -0.42
RRN3-201ENST00000198767 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RRN3-201ENST00000198767 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.42□□□□□ -0.42
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RRN3-201ENST00000198767 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.41□□□□□ -0.42
RRN3-201ENST00000198767 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.4□□□□□ -0.42
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RRN3-201ENST00000198767 JPH4Q96JJ6 628 aa12.38□□□□□ -0.43
RRN3-201ENST00000198767 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.37□□□□□ -0.43
RRN3-201ENST00000198767 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.37□□□□□ -0.43
RRN3-201ENST00000198767 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.37□□□□□ -0.43
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RRN3-201ENST00000198767 FOXD1Q16676 465 aa12.35□□□□□ -0.43
RRN3-201ENST00000198767 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.35□□□□□ -0.43
RRN3-201ENST00000198767 FMN1Q68DA7 1419 aa12.34□□□□□ -0.43
RRN3-201ENST00000198767 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
RRN3-201ENST00000198767 PLEKHD1A6NEE1 506 aa12.34□□□□□ -0.43
RRN3-201ENST00000198767 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.33□□□□□ -0.44
RRN3-201ENST00000198767 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
RRN3-201ENST00000198767 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.441e-10■■□□□ 14.2
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RRN3-201ENST00000198767 GRIN2BQ13224 1484 aa12.29□□□□□ -0.44
RRN3-201ENST00000198767 ANP32CO43423 234 aa12.28□□□□□ -0.44
RRN3-201ENST00000198767 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.28□□□□□ -0.44
RRN3-201ENST00000198767 TONSLQ96HA7 1378 aa12.27□□□□□ -0.44
RRN3-201ENST00000198767 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.27□□□□□ -0.44
RRN3-201ENST00000198767 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.27□□□□□ -0.45
RRN3-201ENST00000198767 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.26□□□□□ -0.45
RRN3-201ENST00000198767 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RRN3-201ENST00000198767 NBR1Q14596 966 aa12.24□□□□□ -0.45
RRN3-201ENST00000198767 TSPY4P0CV99 314 aa12.24□□□□□ -0.45
RRN3-201ENST00000198767 TSPY10P0CW01 314 aa12.24□□□□□ -0.45
RRN3-201ENST00000198767 IFT140Q96RY7 1462 aa12.23□□□□□ -0.45
RRN3-201ENST00000198767 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.22□□□□□ -0.45
RRN3-201ENST00000198767 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.22□□□□□ -0.45
RRN3-201ENST00000198767 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
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RRN3-201ENST00000198767 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
RRN3-201ENST00000198767 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.2□□□□□ -0.46
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RRN3-201ENST00000198767 TIAM1Q13009 1591 aa12.18□□□□□ -0.46
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RRN3-201ENST00000198767 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RRN3-201ENST00000198767 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
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RRN3-201ENST00000198767 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.17□□□□□ -0.46
RRN3-201ENST00000198767 NCOA2Q15596 1464 aa12.16□□□□□ -0.46
RRN3-201ENST00000198767 RGL3Q3MIN7 710 aa12.16□□□□□ -0.46
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RRN3-201ENST00000198767 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.12□□□□□ -0.47
RRN3-201ENST00000198767 MAPKBP1O60336 1514 aa12.11□□□□□ -0.47
RRN3-201ENST00000198767 DEKP35659 375 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
RRN3-201ENST00000198767 GRIN2AQ12879 1464 aa12.11□□□□□ -0.47
RRN3-201ENST00000198767 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.1□□□□□ -0.47
RRN3-201ENST00000198767 IQGAP2Q13576 1575 aa12.1□□□□□ -0.47
RRN3-201ENST00000198767 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.09□□□□□ -0.47
RRN3-201ENST00000198767 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.09□□□□□ -0.47
RRN3-201ENST00000198767 PKD2Q13563 968 aa12.09□□□□□ -0.47
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