RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006658.10

SPATA20-201, Transcript of spermatogenesis associated 20, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPATA20, Length 2,719 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20-201ENST00000006658 MIER1Q8N108 512 aa22.62■■□□□ 1.21
SPATA20-201ENST00000006658 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.59■■□□□ 1.21
SPATA20-201ENST00000006658 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.59■■□□□ 1.21
SPATA20-201ENST00000006658 ARAP1Q96P48 1450 aa22.57■■□□□ 1.2
SPATA20-201ENST00000006658 APLP2Q06481 763 aa22.55■■□□□ 1.2
SPATA20-201ENST00000006658 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SPATA20-201ENST00000006658 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.52■■□□□ 1.2
SPATA20-201ENST00000006658 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.5■■□□□ 1.19
SPATA20-201ENST00000006658 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPATA20-201ENST00000006658 WDR97A6NE52 1622 aa22.4■■□□□ 1.18
SPATA20-201ENST00000006658 P3H3Q8IVL6 736 aa22.4■■□□□ 1.18
SPATA20-201ENST00000006658 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.37■■□□□ 1.17
SPATA20-201ENST00000006658 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPATA20-201ENST00000006658 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.35■■□□□ 1.17
SPATA20-201ENST00000006658 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.33■■□□□ 1.17
SPATA20-201ENST00000006658 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SPATA20-201ENST00000006658 CUL7Q14999 1698 aa22.3■■□□□ 1.16
SPATA20-201ENST00000006658 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.167e-8■■■□□ 18.3
SPATA20-201ENST00000006658 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.24■■□□□ 1.15
SPATA20-201ENST00000006658 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPATA20-201ENST00000006658 ERCC6Q03468 1493 aa22.21■■□□□ 1.15
SPATA20-201ENST00000006658 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPATA20-201ENST00000006658 WDR62O43379 1518 aa22.16■■□□□ 1.14
SPATA20-201ENST00000006658 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPATA20-201ENST00000006658 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.15■■□□□ 1.14
SPATA20-201ENST00000006658 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.11■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 PBRM1Q86U86 1689 aa22.11■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 IFT140Q96RY7 1462 aa22.1■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 TIAM1Q13009 1591 aa22.09■■□□□ 1.13
SPATA20-201ENST00000006658 GRIN2BQ13224 1484 aa22.07■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.07■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 BCANQ96GW7 911 aa22.06■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.03■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 ADAMTS12P58397 1594 aa22.03■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 MSH5O43196 834 aa22.03■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 ITGAEP38570 1179 aa22.02■■□□□ 1.12
SPATA20-201ENST00000006658 MAP3K1Q13233 1512 aa22■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 SAMD9Q5K651 1589 aa21.98■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.98■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.98■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.98■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 FMN1Q68DA7 1419 aa21.97■■□□□ 1.11
SPATA20-201ENST00000006658 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.92■■□□□ 1.1
SPATA20-201ENST00000006658 IQGAP2Q13576 1575 aa21.91■■□□□ 1.1
SPATA20-201ENST00000006658 FBLN2P98095 1184 aa21.91■■□□□ 1.1
SPATA20-201ENST00000006658 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 FKBP8Q14318 412 aa21.87■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 ARID3CA6NKF2 412 aa21.86■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 GRIN2AQ12879 1464 aa21.85■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.85■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.84■■□□□ 1.09
SPATA20-201ENST00000006658 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.82■■□□□ 1.08
SPATA20-201ENST00000006658 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.79■■□□□ 1.08
SPATA20-201ENST00000006658 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SPATA20-201ENST00000006658 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SPATA20-201ENST00000006658 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.77■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 SYNJ2O15056 1496 aa21.76■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 DISP1Q96F81 1524 aa21.75■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.73■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.73■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.73■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.73■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 CEP170Q5SW79 1584 aa21.73■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.71■■□□□ 1.07
SPATA20-201ENST00000006658 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 NCOA2Q15596 1464 aa21.69■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.69■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 KIAA0556O60303 1618 aa21.68■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.68■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 HECW1Q76N89 1606 aa21.65■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 JPH4Q96JJ6 628 aa21.64■■□□□ 1.06
SPATA20-201ENST00000006658 NEFLP07196 543 aa21.64■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.63■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 NUP160Q12769 1436 aa21.63■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.63■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.62■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.61■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 PTPRKQ15262 1439 aa21.6■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 KCNH8Q96L42 1107 aa21.59■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SPATA20-201ENST00000006658 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
SPATA20-201ENST00000006658 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.57■■□□□ 1.04
SPATA20-201ENST00000006658 ARHGEF11O15085 1522 aa21.55■■□□□ 1.04
SPATA20-201ENST00000006658 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.52■■□□□ 1.03
SPATA20-201ENST00000006658 MAPKBP1O60336 1514 aa21.5■■□□□ 1.03
SPATA20-201ENST00000006658 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SPATA20-201ENST00000006658 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.49■■□□□ 1.03
SPATA20-201ENST00000006658 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms