RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	OR2T2	Q6IF00	324 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DPH3	Q96FX2	82 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	LINC00846	Q9NV44	126 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	ERG28	Q9UKR5	140 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615		U3KQA8	63 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	EP400	Q96L91	3159 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SYNJ1	O43426	1573 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	LAMB1	P07942	1786 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	TET3	O43151	1660 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	MUC3A	Q02505	3323 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	USP34	Q70CQ2	3546 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	WDR97	A6NE52	1622 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	C5orf42	Q9H799	3197 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	KDM5C	P41229	1560 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CFAP54	Q96N23	3096 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A1B0GX51	115 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615		J3QLW9	94 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	TNFSF15	O95150	251 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	NMB	P08949	121 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	IFITM1	P13164	125 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SPANXC	Q9NY87	97 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	RGPD5	Q99666	1765 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	TCHH	Q07283	1943 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	PLXNB2	O15031	1838 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	PSME4	Q14997	1843 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	RELN	P78509	3460 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM92A	A1XBS5	289 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615		H0YJX3	145 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC179	H3BU77	68 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SCT	P09683	121 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC153	Q494R4	210 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CASZ1	Q86V15	1759 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	UNC13B	O14795	1591 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	REV3L	O60673	3130 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CHD1	O14646	1710 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	COL4A6	Q14031	1691 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	PCNT	O95613	3336 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAH2	Q9P225	4427 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615		K7EQZ3	153 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	CCL3L1	P16619	93 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	HAMP	P81172	84 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DEFA5	Q01523	94 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	C20orf197	Q8N268	126 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615		V9GYV3	84 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
CBWD5-231	ENST00000495615	MYH8	P13535	1937 aa		-0.07	□□□□□ -2.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms