RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148		K7EP13	123 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	MGP	P08493	103 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	NTF3	P20783	257 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	ADIRF	Q15847	76 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	CLLU1	Q5K131	121 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	LELP1	Q5T871	98 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	ISOC2	Q96AB3	205 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	XG	P55808	180 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148		Q9UF83	564 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148		A0A087WWC5	75 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148		H7C1H1	209 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	EVI2A	P22794	236 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	TWIST1	Q15672	202 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	TSKU	Q8WUA8	353 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	BORCS7	Q96B45	105 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	FAM231B	A6NCW3	169 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2D3	P61077	147 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2D2	P62837	147 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MIB2-223	ENST00000508148	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP10-1	P60331	282 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	IFITM2	Q01629	132 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148		V9GYV3	84 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	HIGD1C	A8MV81	97 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148		A0A087WTM6	91 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	EPM2A	B3EWF7	344 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1B0GUT8	65 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148		M0QY20	66 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	RASL11A	Q6T310	242 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MIB2-223	ENST00000508148		Q5VSD8	79 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	UQCC3	Q6UW78	93 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	NUP35	Q8NFH5	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	FRZB	Q92765	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-33	P01772	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	RIG	Q13278	110 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	NIT2	Q9NQR4	276 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	EREG	O14944	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	HAMP	P81172	84 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	LAGE3	Q14657	143 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	MYCBP2	O75592	4640 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	PPP1R2P9	O14990	202 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	NIT1	Q86X76	327 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148		A0A087WX48	190 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	PKIA	P61925	76 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148		Q8N3U1	123 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1B0GW15	77 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MIB2-223	ENST00000508148	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MIB2-223	ENST00000508148	COMMD7	Q86VX2	200 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MIB2-223	ENST00000508148	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MIB2-223	ENST00000508148	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MIB2-223	ENST00000508148	MT-ND4L	P03901	98 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MIB2-223	ENST00000508148	GCSH	P23434	173 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MIB2-223	ENST00000508148	ELOB	Q15370	118 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MIB2-223	ENST00000508148	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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