RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Epdr1Q99M71 224 aa8.29□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrps14Q9CR88 128 aa8.29□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Golt1aQ9DCQ3 133 aa8.29□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bap18Q9DCT6 171 aa8.29□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hbb-bh2B2RVB7 147 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Amn1B8JKV0 258 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P2ry1P49650 373 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrhbpQ60571 322 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd46Q8BTZ5 228 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stfa2l1Q8BWM3 103 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxph3Q91VX5 252 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cmtm3Q99LJ5 184 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf2Q9CQJ4 336 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zcchc12Q9CZA5 402 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SdhcQ9CZB0 169 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r63Q9EPT1 300 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfrsf23Q9ER63 176 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr12Q9JJA4 423 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NagkQ9QZ08 343 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pard6aQ9Z101 346 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vps13dB1ART2 4390 aa8.28□□□□□ -1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp950A0A0U1RQ46 609 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krtap16-1A2A5X5 502 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl8A2AUU0 281 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm15140A2BEE3 237 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm14408E9Q6B9 136 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4778L7N229 365 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3532M0QWL4 194 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klf9O35739 244 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FmodP50608 376 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q4KKZ1 196 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1178Q7TR20 323 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gphb5Q812B2 130 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdkl3Q8BLF2 595 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmed4Q8R1V4 227 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r229Q8R2A9 306 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sfxn4Q925N1 313 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyb5bQ9CQX2 146 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr710Q9EP55 310 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pxmp4Q9JJW0 212 aa8.27□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc34bA0A140T8I4 237 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav12d-1A0N8R0 115 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm14403A2BFU4 402 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhox3gB9EJQ9 160 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21244J3QK38 227 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr905L7N1X5 310 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Reg3gO09049 174 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Efnb2P52800 336 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lclat1Q3UN02 376 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Obox7Q4KL20 218 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr907Q7TRC7 310 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q80W69 301 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nmes1Q810Q5 83 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r35Q8R2E2 296 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r37Q8R2E4 302 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arl6ip5Q8R5J9 188 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbpms2Q8VC52 206 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DapQ91XC8 102 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem205Q91XE8 189 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6525A0A0A6YW33 106 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv14-130A0A0G2JF45 117 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr872E9PVW2 323 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr419E9Q0Y7 313 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 JtbO88824 146 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SbpP15501 199 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BaxQ07813 192 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znrf2Q71FD5 238 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ak6Q8VCP8 172 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem183Q9JJB9 375 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a10Q9QZD8 287 aa8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Timm9Q9WV98 89 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SacsQ9JLC8 4582 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC053393A0A0B4J1F6 192 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss47A0A0N4SVQ0 395 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fthl17bA2AHC5 176 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fthl17cA2AHC6 176 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd66J3QNN4 192 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrygbP04344 175 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P06330 118 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifna6P07350 189 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pax1P09084 446 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ca5aP23589 299 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sssca1P56873 199 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc45a2P58355 530 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ufd1P70362 307 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crisp3Q03402 241 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lyrm9Q3UN90 78 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vamp1Q62442 118 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tas2r114Q7M722 309 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prdx6bQ8BG37 224 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc37a1Q8R070 531 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snx18Q91ZR2 614 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab32Q9CZE3 223 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl9Q9EPL4 318 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpa33Q9JKA5 319 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnd2Q9QYM5 227 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav6-1A0A075B5Z8 112 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 90 ms