Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Ifna6P07350 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Ifna6P07350 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Ifna6P07350 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ifna6P07350 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
Ifna6P07350 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ifna6P07350 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Ifna6P07350 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ifna6P07350 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ifna6P07350 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ifna6P07350 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ifna6P07350 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ifna6P07350 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ifna6P07350 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ifna6P07350 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Ifna6P07350 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Ifna6P07350 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ifna6P07350 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ifna6P07350 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ifna6P07350 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ifna6P07350 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ifna6P07350 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Ifna6P07350 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Ifna6P07350 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ifna6P07350 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Ifna6P07350 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Ifna6P07350 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
Ifna6P07350 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Ifna6P07350 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Ifna6P07350 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Ifna6P07350 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ifna6P07350 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ifna6P07350 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Ifna6P07350 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Ifna6P07350 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
Ifna6P07350 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ifna6P07350 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Ifna6P07350 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Ifna6P07350 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ifna6P07350 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ifna6P07350 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ifna6P07350 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,8■■□□□ 1,4
Ifna6P07350 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ifna6P07350 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ifna6P07350 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ifna6P07350 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ifna6P07350 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ifna6P07350 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Ifna6P07350 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ifna6P07350 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ifna6P07350 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ifna6P07350 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ifna6P07350 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Ifna6P07350 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ifna6P07350 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ifna6P07350 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ifna6P07350 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ifna6P07350 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ifna6P07350 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Ifna6P07350 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ifna6P07350 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Ifna6P07350 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ifna6P07350 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ifna6P07350 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ifna6P07350 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ifna6P07350 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ifna6P07350 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ifna6P07350 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Ifna6P07350 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Ifna6P07350 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Ifna6P07350 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,06■■□□□ 1,28
Ifna6P07350 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ifna6P07350 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ifna6P07350 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ifna6P07350 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ifna6P07350 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ifna6P07350 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ifna6P07350 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ifna6P07350 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ifna6P07350 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ifna6P07350 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ifna6P07350 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ifna6P07350 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ifna6P07350 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ifna6P07350 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ifna6P07350 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ifna6P07350 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ifna6P07350 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ifna6P07350 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Ifna6P07350 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Ifna6P07350 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Ifna6P07350 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ifna6P07350 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ifna6P07350 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Ifna6P07350 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ifna6P07350 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ifna6P07350 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ifna6P07350 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Ifna6P07350 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ifna6P07350 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,9 ms