Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ifna6P07350 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ifna6P07350 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ifna6P07350 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ifna6P07350 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifna6P07350 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ifna6P07350 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ifna6P07350 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ifna6P07350 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ifna6P07350 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ifna6P07350 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ifna6P07350 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ifna6P07350 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ifna6P07350 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifna6P07350 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifna6P07350 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ifna6P07350 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifna6P07350 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifna6P07350 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifna6P07350 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifna6P07350 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ifna6P07350 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifna6P07350 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ifna6P07350 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ifna6P07350 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifna6P07350 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifna6P07350 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifna6P07350 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifna6P07350 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifna6P07350 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifna6P07350 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifna6P07350 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifna6P07350 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifna6P07350 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifna6P07350 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifna6P07350 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifna6P07350 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifna6P07350 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifna6P07350 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifna6P07350 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifna6P07350 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifna6P07350 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifna6P07350 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifna6P07350 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifna6P07350 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifna6P07350 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifna6P07350 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifna6P07350 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifna6P07350 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifna6P07350 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifna6P07350 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifna6P07350 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifna6P07350 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ifna6P07350 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifna6P07350 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifna6P07350 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifna6P07350 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifna6P07350 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifna6P07350 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifna6P07350 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifna6P07350 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifna6P07350 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifna6P07350 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifna6P07350 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifna6P07350 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifna6P07350 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifna6P07350 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifna6P07350 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifna6P07350 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifna6P07350 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifna6P07350 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifna6P07350 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifna6P07350 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifna6P07350 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifna6P07350 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifna6P07350 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifna6P07350 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifna6P07350 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifna6P07350 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifna6P07350 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifna6P07350 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifna6P07350 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifna6P07350 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifna6P07350 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifna6P07350 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifna6P07350 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifna6P07350 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifna6P07350 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifna6P07350 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifna6P07350 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifna6P07350 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifna6P07350 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifna6P07350 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifna6P07350 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifna6P07350 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifna6P07350 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifna6P07350 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifna6P07350 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifna6P07350 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifna6P07350 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms