Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Sssca1P56873 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sssca1P56873 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sssca1P56873 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sssca1P56873 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sssca1P56873 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sssca1P56873 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sssca1P56873 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sssca1P56873 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sssca1P56873 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sssca1P56873 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sssca1P56873 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sssca1P56873 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sssca1P56873 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sssca1P56873 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sssca1P56873 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sssca1P56873 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sssca1P56873 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sssca1P56873 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sssca1P56873 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sssca1P56873 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sssca1P56873 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sssca1P56873 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sssca1P56873 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sssca1P56873 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sssca1P56873 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sssca1P56873 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sssca1P56873 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sssca1P56873 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sssca1P56873 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sssca1P56873 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sssca1P56873 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sssca1P56873 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sssca1P56873 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sssca1P56873 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sssca1P56873 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sssca1P56873 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sssca1P56873 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sssca1P56873 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sssca1P56873 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sssca1P56873 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sssca1P56873 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sssca1P56873 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sssca1P56873 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sssca1P56873 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sssca1P56873 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sssca1P56873 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sssca1P56873 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sssca1P56873 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sssca1P56873 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sssca1P56873 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sssca1P56873 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sssca1P56873 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sssca1P56873 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sssca1P56873 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sssca1P56873 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sssca1P56873 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sssca1P56873 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sssca1P56873 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sssca1P56873 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sssca1P56873 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sssca1P56873 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sssca1P56873 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sssca1P56873 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sssca1P56873 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sssca1P56873 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sssca1P56873 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sssca1P56873 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sssca1P56873 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sssca1P56873 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sssca1P56873 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sssca1P56873 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sssca1P56873 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sssca1P56873 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sssca1P56873 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sssca1P56873 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sssca1P56873 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sssca1P56873 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sssca1P56873 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sssca1P56873 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sssca1P56873 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sssca1P56873 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sssca1P56873 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sssca1P56873 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sssca1P56873 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sssca1P56873 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sssca1P56873 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sssca1P56873 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sssca1P56873 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sssca1P56873 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sssca1P56873 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sssca1P56873 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sssca1P56873 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sssca1P56873 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sssca1P56873 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sssca1P56873 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sssca1P56873 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sssca1P56873 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sssca1P56873 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sssca1P56873 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms