RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 C4orf33Q8N1A6 199 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 AIF1LQ9BQI0 150 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPC2P61916 151 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 MORN2Q502X0 79 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMGT1Q8N4V1 131 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 CASZ1Q86V15 1759 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLXNA2O75051 1894 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A087WTM6 91 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 APODP05090 189 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 NMBP08949 121 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCGB1A1P11684 91 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPCS2Q15005 226 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 C20orf197Q8N268 126 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX7B2Q8TF08 81 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAR1AQ9NR31 198 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM242Q9NWH2 141 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPTBN2O15020 2390 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC01545Q5VT33 79 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 PYDC1Q8WXC3 89 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFA12Q9UI09 145 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 U3KQA8 63 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 V9GYV3 84 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 KDM5CP41229 1560 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 DR1Q01658 176 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q96NJ1 140 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNC13BO14795 1591 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACYP2P14621 99 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKAP14Q86UN6 197 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPRMP28827 1452 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERCC6Q03468 1493 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 FLNCQ14315 2725 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 J3QR89 54 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLC6P0CF74 106 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 CKS1BP61024 79 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q6ZRX8 168 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKAP6Q13023 2319 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNJ1O43426 1573 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF292O60281 2723 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 A6NIN4 97 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 M0R129 80 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIRTP0C851 137 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCHFRP30047 84 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMIM3Q9BZL3 60 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 BATF3Q9NR55 127 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPRMQ9NS64 109 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSKIPQ9P0R6 139 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCOR1O75376 2440 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 DISP2A7MBM2 1401 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 OVOS2Q6IE36 1432 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 M0R2Z0 102 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFITM1P13164 125 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 EDDM3BP56851 147 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 INSL4Q14641 139 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 LZICQ8WZA0 190 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPN13Q12923 2485 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSC5DA1L4H1 1573 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPAN19P0C672 248 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00694P0DN24 101 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACNA1AO00555 2505 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 C10orf142B7Z368 130 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARPC5O15511 151 aa-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 167 ms