RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361029.8

TRDN-202, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 5

Gene TRDN, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-202ENST00000361029 IGHV3-33P01772 117 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 PRH1P02810 166 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 FABP2P12104 132 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 FABP4P15090 132 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 ESPL1Q14674 2120 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 ATOH7Q8N100 152 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 LIMD2Q9BT23 127 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 DDA1Q9BW61 102 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 CST11Q9H112 138 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 ATPIF1Q9UII2 106 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 MED31Q9Y3C7 131 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 FRYLO94915 3013 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 AKAP11Q9UKA4 1901 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa0.36□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 NUP188Q5SRE5 1749 aa0.35□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 LRRC37A3O60309 1634 aa0.35□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 PREX2Q70Z35 1606 aa0.35□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 APC2O95996 2303 aa0.35□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 CSPG4Q6UVK1 2322 aa0.35□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa0.35□□□□□ -2.35
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TRDN-202ENST00000361029 MT-ND6P03923 174 aa0.35□□□□□ -2.35
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TRDN-202ENST00000361029 NEFHP12036 1026 aa0.35□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
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TRDN-202ENST00000361029 ISOC1Q96CN7 298 aa0.35□□□□□ -2.35
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TRDN-202ENST00000361029 CCDC32Q9BV29 185 aa0.35□□□□□ -2.35
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TRDN-202ENST00000361029 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.35□□□□□ -2.35
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TRDN-202ENST00000361029 ADCY10Q96PN6 1610 aa0.35□□□□□ -2.35
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TRDN-202ENST00000361029 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa0.34□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 COL7A1Q02388 2944 aa0.34□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 COL12A1Q99715 3063 aa0.34□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 MED13LQ71F56 2210 aa0.34□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.35
TRDN-202ENST00000361029 LRBAP50851 2863 aa0.34□□□□□ -2.35
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TRDN-202ENST00000361029 A0A096LPI6 279 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa0.34□□□□□ -2.36
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TRDN-202ENST00000361029 NBEAP1P0C6P0 100 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 SDC2P34741 201 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 EEA1Q15075 1411 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 TEX29Q8N6K0 151 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 MORN4Q8NDC4 146 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 OR5H6Q8NGV6 325 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 CLEC2BQ92478 149 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 CCDC115Q96NT0 180 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 ABCA3Q99758 1704 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 SMR3AQ99954 134 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 TANC1Q9C0D5 1861 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 CBLN4Q9NTU7 201 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa0.34□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 MAP3K1Q13233 1512 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 KDM5DQ9BY66 1539 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 CUBNO60494 3623 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 FREM2Q5SZK8 3169 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 KNTC1P50748 2209 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 DISP2A7MBM2 1401 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 C10orf71Q711Q0 1435 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 A0A0J9YY99 117 aa0.33□□□□□ -2.36
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TRDN-202ENST00000361029 MAXP61244 160 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 VMA21Q3ZAQ7 101 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 TMEM128Q5BJH2 165 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 Q5XG85 94 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 Q6ZS92 163 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 LINC00305Q7Z4B0 112 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 CROCCP2Q86T23 111 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 OR4B1Q8NGF8 309 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 GRPEL2Q8TAA5 225 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 NAT14Q8WUY8 206 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 PRELID3AQ96N28 172 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 NABP2Q9BQ15 211 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 SELENOSQ9BQE4 189 aa0.33□□□□□ -2.36
TRDN-202ENST00000361029 LPAR5Q9H1C0 372 aa0.33□□□□□ -2.36
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