RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023154.2

Cldn1-201, Transcript of Claudin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn1, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm10447Q3UQ92 135 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ms4a13Q5FWC3 203 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 CrygcQ61597 174 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Adora3Q61618 319 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Scgb2b24Q7M747 112 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem212Q8C6V3 187 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Q8C708 225 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 9130230L23RikQ8CC80 163 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 C1qtnf4Q8R066 326 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1295Q8VF48 312 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ythdf2Q91YT7 579 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tln2Q71LX4 2375 aa7.4□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ighv1-7A0A075B5T7 117 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm28778A0A087WSK7 233 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1016A2ASV2 309 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm10665K7N6B7 321 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cd74P04441 279 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 HrasQ61411 189 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1474Q7TQQ8 314 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Arl6ip6Q8BH07 226 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ankrd33Q8BXP5 385 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm4894Q8CA09 118 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Plppr2Q8VCY8 343 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 FibinQ9CQS3 217 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cysrt1Q9D1E4 142 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr912A0A1L1SSS5 310 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Vmn1r113G3UWI8 307 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 F2rl2O08675 369 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nkx2-8O70584 235 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ApcsP12246 224 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Znf787Q8BIF9 381 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 GrhprQ91Z53 328 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ndufa11Q9D8B4 141 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cyb5r3Q9DCN2 301 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 TslpQ9JIE6 140 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr154Q9QY00 318 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem116A0A0G2JGD3 401 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm45800A0A1B0GT24 152 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc35d1A2AKQ0 355 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm10073E9Q3T0 114 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm21974F6W3F3 119 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rpl23P62830 140 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rwdd3Q8VIL2 267 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Col13a1Q9R1N9 751 aa7.39□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ighv14-3A0A075B5R9 117 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Scgb1b12A0A087WP21 93 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 H2-M5A7VMS3 348 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm21244J3QK38 227 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rab33bO35963 229 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hoxa5P09021 270 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hoxa1P09022 331 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pdlim4P70271 330 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Arrdc5Q497K5 325 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 C1qtnf9Q4ZJN1 333 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr917Q7TRC3 309 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sfxn4Q925N1 313 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Actl6bQ99MR0 426 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 4933414I15RikQ9D4D5 133 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Spaca3Q9D9X8 221 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Lsm4Q9QXA5 137 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gpr132Q9Z282 382 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1124A2AT86 318 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ovol3D3YYM0 189 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm4791J3QQ14 102 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cdkn1aP39689 159 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Aadacl4Q8BM81 407 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zg16Q8K0C5 167 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ptrh2Q8R2Y8 181 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ssbp2Q9CYZ8 361 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Try5Q9QUK9 246 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Try4Q9R0T7 246 aa7.38□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr177E9Q7W1 309 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Klk1b22P15948 259 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Msrb3Q8BU85 253 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rbm14Q8C2Q3 669 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Q8CF25 301 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr476Q8VGI4 310 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmprss11dQ8VHK8 417 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Eny2Q9JIX0 101 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Itpr3P70227 2670 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Igkv1-131A0A140T8M8 120 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fcrl6A1YIY0 268 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Irf2bp2E9Q1P8 570 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm20825J3QM67 227 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm8653K9J7G2 307 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Vmn1r117L7N2C9 307 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc25a17O70579 307 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ssty2Q149W4 227 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm21394Q497R7 227 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 C1ql4Q4ZJM9 238 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 SlaQ60898 281 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 MiaQ61865 130 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm20854Q62461 227 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Usf2Q64705 346 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Polr3kQ9CQZ7 108 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mlst8Q9DCJ1 326 aa7.37□□□□□ -1.23
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm9195A0A140LHT4 2805 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.5 ms