Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Rab33bO35963 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Rab33bO35963 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rab33bO35963 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Rab33bO35963 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Rab33bO35963 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Rab33bO35963 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rab33bO35963 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Rab33bO35963 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Rab33bO35963 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Rab33bO35963 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Rab33bO35963 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Rab33bO35963 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Rab33bO35963 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
Rab33bO35963 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rab33bO35963 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
Rab33bO35963 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Rab33bO35963 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Rab33bO35963 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rab33bO35963 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Rab33bO35963 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rab33bO35963 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rab33bO35963 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rab33bO35963 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rab33bO35963 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rab33bO35963 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rab33bO35963 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,39■■□□□ 1,65
Rab33bO35963 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Rab33bO35963 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rab33bO35963 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Rab33bO35963 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Rab33bO35963 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Rab33bO35963 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Rab33bO35963 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rab33bO35963 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rab33bO35963 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Rab33bO35963 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Rab33bO35963 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rab33bO35963 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rab33bO35963 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Rab33bO35963 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Rab33bO35963 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Rab33bO35963 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Rab33bO35963 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Rab33bO35963 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Rab33bO35963 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Rab33bO35963 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Rab33bO35963 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Rab33bO35963 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Rab33bO35963 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Rab33bO35963 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Rab33bO35963 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Rab33bO35963 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
Rab33bO35963 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Rab33bO35963 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Rab33bO35963 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Rab33bO35963 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Rab33bO35963 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
Rab33bO35963 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Rab33bO35963 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Rab33bO35963 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Rab33bO35963 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Rab33bO35963 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Rab33bO35963 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Rab33bO35963 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Rab33bO35963 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Rab33bO35963 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Rab33bO35963 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Rab33bO35963 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Rab33bO35963 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Rab33bO35963 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Rab33bO35963 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Rab33bO35963 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Rab33bO35963 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Rab33bO35963 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Rab33bO35963 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
Rab33bO35963 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
Rab33bO35963 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Rab33bO35963 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Rab33bO35963 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Rab33bO35963 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Rab33bO35963 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,58■■□□□ 1,36
Rab33bO35963 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Rab33bO35963 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Rab33bO35963 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rab33bO35963 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Rab33bO35963 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rab33bO35963 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rab33bO35963 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Rab33bO35963 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Rab33bO35963 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Rab33bO35963 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Rab33bO35963 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Rab33bO35963 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Rab33bO35963 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Rab33bO35963 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
Rab33bO35963 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Rab33bO35963 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Rab33bO35963 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Rab33bO35963 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,13■■□□□ 1,29
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