Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP21

Scgb1b12, ABPA12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b12A0A087WP21 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Scgb1b12A0A087WP21 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Scgb1b12A0A087WP21 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Scgb1b12A0A087WP21 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Scgb1b12A0A087WP21 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Scgb1b12A0A087WP21 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Scgb1b12A0A087WP21 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Scgb1b12A0A087WP21 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Scgb1b12A0A087WP21 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Scgb1b12A0A087WP21 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Scgb1b12A0A087WP21 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Scgb1b12A0A087WP21 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Scgb1b12A0A087WP21 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Scgb1b12A0A087WP21 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Scgb1b12A0A087WP21 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Scgb1b12A0A087WP21 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Scgb1b12A0A087WP21 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Scgb1b12A0A087WP21 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Scgb1b12A0A087WP21 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Scgb1b12A0A087WP21 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Scgb1b12A0A087WP21 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Scgb1b12A0A087WP21 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Scgb1b12A0A087WP21 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Scgb1b12A0A087WP21 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23,21■■□□□ 1,31
Scgb1b12A0A087WP21 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Scgb1b12A0A087WP21 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Scgb1b12A0A087WP21 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Scgb1b12A0A087WP21 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Scgb1b12A0A087WP21 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Scgb1b12A0A087WP21 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Scgb1b12A0A087WP21 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Scgb1b12A0A087WP21 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Scgb1b12A0A087WP21 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Scgb1b12A0A087WP21 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
Scgb1b12A0A087WP21 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Scgb1b12A0A087WP21 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Scgb1b12A0A087WP21 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Scgb1b12A0A087WP21 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Scgb1b12A0A087WP21 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,58■■□□□ 1,2
Scgb1b12A0A087WP21 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Scgb1b12A0A087WP21 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Scgb1b12A0A087WP21 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Scgb1b12A0A087WP21 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Scgb1b12A0A087WP21 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Scgb1b12A0A087WP21 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Scgb1b12A0A087WP21 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Scgb1b12A0A087WP21 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Scgb1b12A0A087WP21 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Scgb1b12A0A087WP21 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Scgb1b12A0A087WP21 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Scgb1b12A0A087WP21 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Scgb1b12A0A087WP21 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Scgb1b12A0A087WP21 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Scgb1b12A0A087WP21 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Scgb1b12A0A087WP21 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Scgb1b12A0A087WP21 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Scgb1b12A0A087WP21 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,05■■□□□ 1,12
Scgb1b12A0A087WP21 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Scgb1b12A0A087WP21 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Scgb1b12A0A087WP21 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Scgb1b12A0A087WP21 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,02■■□□□ 1,12
Scgb1b12A0A087WP21 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,11
Scgb1b12A0A087WP21 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Scgb1b12A0A087WP21 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Scgb1b12A0A087WP21 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Scgb1b12A0A087WP21 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Scgb1b12A0A087WP21 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Scgb1b12A0A087WP21 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Scgb1b12A0A087WP21 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Scgb1b12A0A087WP21 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Scgb1b12A0A087WP21 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Scgb1b12A0A087WP21 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Scgb1b12A0A087WP21 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Scgb1b12A0A087WP21 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Scgb1b12A0A087WP21 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Scgb1b12A0A087WP21 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Scgb1b12A0A087WP21 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Scgb1b12A0A087WP21 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Scgb1b12A0A087WP21 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Scgb1b12A0A087WP21 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Scgb1b12A0A087WP21 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,6■■□□□ 1,05
Scgb1b12A0A087WP21 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Scgb1b12A0A087WP21 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Scgb1b12A0A087WP21 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Scgb1b12A0A087WP21 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Scgb1b12A0A087WP21 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21,54■■□□□ 1,04
Scgb1b12A0A087WP21 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Scgb1b12A0A087WP21 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Scgb1b12A0A087WP21 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Scgb1b12A0A087WP21 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Scgb1b12A0A087WP21 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,03
Scgb1b12A0A087WP21 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Scgb1b12A0A087WP21 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,43■■□□□ 1,02
Scgb1b12A0A087WP21 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,41■■□□□ 1,02
Scgb1b12A0A087WP21 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Scgb1b12A0A087WP21 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Scgb1b12A0A087WP21 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Scgb1b12A0A087WP21 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Scgb1b12A0A087WP21 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Scgb1b12A0A087WP21 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
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