Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G2

Gm8653, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8653K9J7G2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Gm8653K9J7G2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Gm8653K9J7G2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Gm8653K9J7G2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Gm8653K9J7G2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Gm8653K9J7G2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Gm8653K9J7G2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gm8653K9J7G2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gm8653K9J7G2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gm8653K9J7G2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gm8653K9J7G2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gm8653K9J7G2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Gm8653K9J7G2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Gm8653K9J7G2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,33■■□□□ 1,49
Gm8653K9J7G2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Gm8653K9J7G2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Gm8653K9J7G2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gm8653K9J7G2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
Gm8653K9J7G2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
Gm8653K9J7G2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Gm8653K9J7G2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Gm8653K9J7G2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Gm8653K9J7G2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Gm8653K9J7G2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Gm8653K9J7G2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Gm8653K9J7G2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Gm8653K9J7G2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Gm8653K9J7G2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Gm8653K9J7G2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Gm8653K9J7G2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
Gm8653K9J7G2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Gm8653K9J7G2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Gm8653K9J7G2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Gm8653K9J7G2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Gm8653K9J7G2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Gm8653K9J7G2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,37■■□□□ 1,33
Gm8653K9J7G2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Gm8653K9J7G2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Gm8653K9J7G2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gm8653K9J7G2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Gm8653K9J7G2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Gm8653K9J7G2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
Gm8653K9J7G2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gm8653K9J7G2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gm8653K9J7G2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Gm8653K9J7G2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Gm8653K9J7G2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Gm8653K9J7G2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Gm8653K9J7G2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Gm8653K9J7G2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Gm8653K9J7G2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Gm8653K9J7G2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Gm8653K9J7G2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Gm8653K9J7G2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
Gm8653K9J7G2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Gm8653K9J7G2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Gm8653K9J7G2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Gm8653K9J7G2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Gm8653K9J7G2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,61■■□□□ 1,21
Gm8653K9J7G2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Gm8653K9J7G2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Gm8653K9J7G2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Gm8653K9J7G2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Gm8653K9J7G2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Gm8653K9J7G2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Gm8653K9J7G2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Gm8653K9J7G2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Gm8653K9J7G2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Gm8653K9J7G2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Gm8653K9J7G2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Gm8653K9J7G2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,42■■□□□ 1,18
Gm8653K9J7G2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,39■■□□□ 1,17
Gm8653K9J7G2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Gm8653K9J7G2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Gm8653K9J7G2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Gm8653K9J7G2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Gm8653K9J7G2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Gm8653K9J7G2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,15
Gm8653K9J7G2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Gm8653K9J7G2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Gm8653K9J7G2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,22■■□□□ 1,15
Gm8653K9J7G2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Gm8653K9J7G2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Gm8653K9J7G2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gm8653K9J7G2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Gm8653K9J7G2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Gm8653K9J7G2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Gm8653K9J7G2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Gm8653K9J7G2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Gm8653K9J7G2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Gm8653K9J7G2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Gm8653K9J7G2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Gm8653K9J7G2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Gm8653K9J7G2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Gm8653K9J7G2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Gm8653K9J7G2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Gm8653K9J7G2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Gm8653K9J7G2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Gm8653K9J7G2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Gm8653K9J7G2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,3 ms