Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G2

Gm8653, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8653K9J7G2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm8653K9J7G2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm8653K9J7G2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm8653K9J7G2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm8653K9J7G2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm8653K9J7G2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm8653K9J7G2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm8653K9J7G2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm8653K9J7G2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8653K9J7G2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm8653K9J7G2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm8653K9J7G2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm8653K9J7G2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm8653K9J7G2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8653K9J7G2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8653K9J7G2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8653K9J7G2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm8653K9J7G2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm8653K9J7G2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8653K9J7G2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm8653K9J7G2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8653K9J7G2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm8653K9J7G2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm8653K9J7G2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8653K9J7G2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm8653K9J7G2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm8653K9J7G2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8653K9J7G2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8653K9J7G2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8653K9J7G2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8653K9J7G2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8653K9J7G2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8653K9J7G2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8653K9J7G2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8653K9J7G2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8653K9J7G2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8653K9J7G2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8653K9J7G2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8653K9J7G2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8653K9J7G2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8653K9J7G2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8653K9J7G2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8653K9J7G2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8653K9J7G2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8653K9J7G2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8653K9J7G2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8653K9J7G2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8653K9J7G2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8653K9J7G2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8653K9J7G2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm8653K9J7G2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8653K9J7G2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8653K9J7G2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8653K9J7G2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8653K9J7G2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8653K9J7G2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8653K9J7G2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8653K9J7G2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8653K9J7G2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8653K9J7G2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8653K9J7G2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8653K9J7G2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8653K9J7G2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8653K9J7G2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8653K9J7G2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8653K9J7G2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8653K9J7G2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8653K9J7G2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8653K9J7G2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8653K9J7G2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8653K9J7G2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8653K9J7G2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8653K9J7G2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8653K9J7G2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8653K9J7G2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8653K9J7G2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8653K9J7G2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8653K9J7G2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm8653K9J7G2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8653K9J7G2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8653K9J7G2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8653K9J7G2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8653K9J7G2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8653K9J7G2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8653K9J7G2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8653K9J7G2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8653K9J7G2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8653K9J7G2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8653K9J7G2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8653K9J7G2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8653K9J7G2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8653K9J7G2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8653K9J7G2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8653K9J7G2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8653K9J7G2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm8653K9J7G2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8653K9J7G2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8653K9J7G2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm8653K9J7G2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm8653K9J7G2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms