RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr779E9PUS9 130 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 9130204L05RikG3UWB8 92 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cldn34c3J3QJW5 233 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cldn34c2J3QNM1 233 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A630076J17RikJ3QQ32 107 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CckarO08786 436 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnfsf12O54907 249 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Edn1P22387 202 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oprk1P33534 380 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CenptQ3TJM4 515 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 G430049J08RikQ3TL09 166 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Taar4Q5QD15 347 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psg17Q62056 475 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1474Q7TQQ8 314 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dppa1Q810Y7 116 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cldn34c1Q8K193 234 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1009Q8VFK1 314 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm20422E9PUR3 255 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr191L7N1Z8 309 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SncaO55042 140 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cnn1Q08091 297 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MidnQ3TPJ7 465 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnip4Q6PHZ8 250 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Megf9Q8BH27 600 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr124Q8VGW6 315 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znrf1Q91V17 227 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpa33Q9JKA5 319 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hs3st3b1Q9QZS6 390 aa14.09□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DscamQ9ERC8 2013 aa14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r78K7N608 313 aa14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klk1b22P15948 259 aa14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pax5Q02650 391 aa14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xaf1Q5NBU8 273 aa14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vwc2Q8C8N3 324 aa14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc20Q8CI70 184 aa14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2afb1Q9CQ70 111 aa14.08□□□□□ -0.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr251E9Q891 316 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm21244J3QK38 227 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gfra3O35118 397 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mef2bO55087 349 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cst7O89098 144 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P06323 132 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssty1P13675 232 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gabra2P26048 451 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sfrp2P97299 295 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp941Q3URY5 674 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NotoQ5TIS6 240 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q6DIA7 600 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cma2Q91VB1 246 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mpdu1Q9R0Q9 247 aa14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv6-3A0A075B5T2 118 aa14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr58Q7TRF6 309 aa14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rer1Q9CQU3 196 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm21882J3QN86 361 aa14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ifna4P07351 186 aa14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sftpa1P35242 248 aa14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spink11Q09TK7 88 aa14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EpopQ7TNS8 369 aa14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr25Q7TRD6 313 aa14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mlst8Q9DCJ1 326 aa14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lsm4Q9QXA5 137 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm27027S4R1M6 97 aa14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm35060A0A140LIV7 231 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp867E9Q2M4 473 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01788 123 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Defa-rs2P17534 91 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Crebl2Q32M00 123 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smim7Q5RKS2 75 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ypel2Q65Z95 119 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il31Q6EAL8 163 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pld4Q8BG07 503 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pbp2Q8VIN1 187 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scgb3a2Q920H1 91 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NacaP70670 2187 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf385cA2A5E6 429 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mettl23A2AA28 253 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mettl8A2AUU0 281 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tm4sf19E9Q9H8 206 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Npy6rQ61212 371 aa14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv1-19A0A0A6YWX0 117 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv8-9A0A0G2JET1 119 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Degs1O09005 323 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam3dP97805 223 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eaf1Q9D4C5 268 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr35Q9ES90 307 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Frem1Q684R7 2191 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scgb1b10A0A087WPW0 93 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trbv1A0A0B4J1G7 116 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Esp6A8R0U0 136 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm6665F6Y363 85 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1178Q7TR20 323 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ido2Q8R0V5 405 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r237Q8R296 289 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pnpla3Q91WW7 413 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ly6g6dQ9Z1Q3 135 aa14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv5-17A0A075B5R1 117 aa14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P04212 136 aa14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptbp1P17225 527 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RhodP97348 210 aa14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.8 ms