Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Vwc2Q8C8N3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Vwc2Q8C8N3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Vwc2Q8C8N3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Vwc2Q8C8N3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Vwc2Q8C8N3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Vwc2Q8C8N3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Vwc2Q8C8N3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Vwc2Q8C8N3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Vwc2Q8C8N3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Vwc2Q8C8N3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Vwc2Q8C8N3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Vwc2Q8C8N3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Vwc2Q8C8N3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Vwc2Q8C8N3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Vwc2Q8C8N3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Vwc2Q8C8N3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Vwc2Q8C8N3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Vwc2Q8C8N3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Vwc2Q8C8N3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Vwc2Q8C8N3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Vwc2Q8C8N3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Vwc2Q8C8N3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Vwc2Q8C8N3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Vwc2Q8C8N3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Vwc2Q8C8N3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Vwc2Q8C8N3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Vwc2Q8C8N3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Vwc2Q8C8N3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Vwc2Q8C8N3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Vwc2Q8C8N3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Vwc2Q8C8N3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Vwc2Q8C8N3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Vwc2Q8C8N3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Vwc2Q8C8N3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Vwc2Q8C8N3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Vwc2Q8C8N3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Vwc2Q8C8N3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Vwc2Q8C8N3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Vwc2Q8C8N3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Vwc2Q8C8N3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Vwc2Q8C8N3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Vwc2Q8C8N3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Vwc2Q8C8N3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Vwc2Q8C8N3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Vwc2Q8C8N3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Vwc2Q8C8N3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Vwc2Q8C8N3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Vwc2Q8C8N3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Vwc2Q8C8N3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Vwc2Q8C8N3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Vwc2Q8C8N3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Vwc2Q8C8N3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Vwc2Q8C8N3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Vwc2Q8C8N3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Vwc2Q8C8N3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Vwc2Q8C8N3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Vwc2Q8C8N3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Vwc2Q8C8N3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Vwc2Q8C8N3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Vwc2Q8C8N3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Vwc2Q8C8N3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Vwc2Q8C8N3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Vwc2Q8C8N3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
Vwc2Q8C8N3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Vwc2Q8C8N3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Vwc2Q8C8N3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Vwc2Q8C8N3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Vwc2Q8C8N3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Vwc2Q8C8N3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Vwc2Q8C8N3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Vwc2Q8C8N3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Vwc2Q8C8N3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Vwc2Q8C8N3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Vwc2Q8C8N3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Vwc2Q8C8N3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Vwc2Q8C8N3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Vwc2Q8C8N3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Vwc2Q8C8N3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Vwc2Q8C8N3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Vwc2Q8C8N3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,49■■□□□ 1,51
Vwc2Q8C8N3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Vwc2Q8C8N3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Vwc2Q8C8N3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Vwc2Q8C8N3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Vwc2Q8C8N3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Vwc2Q8C8N3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Vwc2Q8C8N3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Vwc2Q8C8N3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Vwc2Q8C8N3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Vwc2Q8C8N3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,31■■□□□ 1,48
Vwc2Q8C8N3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Vwc2Q8C8N3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Vwc2Q8C8N3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Vwc2Q8C8N3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Vwc2Q8C8N3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Vwc2Q8C8N3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Vwc2Q8C8N3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Vwc2Q8C8N3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,19■■□□□ 1,46
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