Protein–RNA interactions for Protein: Q91V17

Znrf1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf1Q91V17 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Znrf1Q91V17 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Znrf1Q91V17 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Znrf1Q91V17 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Znrf1Q91V17 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Znrf1Q91V17 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Znrf1Q91V17 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Znrf1Q91V17 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Znrf1Q91V17 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Znrf1Q91V17 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Znrf1Q91V17 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Znrf1Q91V17 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Znrf1Q91V17 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Znrf1Q91V17 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Znrf1Q91V17 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Znrf1Q91V17 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Znrf1Q91V17 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Znrf1Q91V17 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Znrf1Q91V17 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Znrf1Q91V17 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Znrf1Q91V17 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Znrf1Q91V17 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Znrf1Q91V17 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Znrf1Q91V17 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Znrf1Q91V17 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Znrf1Q91V17 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Znrf1Q91V17 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Znrf1Q91V17 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Znrf1Q91V17 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Znrf1Q91V17 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Znrf1Q91V17 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Znrf1Q91V17 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Znrf1Q91V17 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Znrf1Q91V17 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Znrf1Q91V17 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Znrf1Q91V17 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Znrf1Q91V17 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Znrf1Q91V17 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Znrf1Q91V17 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Znrf1Q91V17 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Znrf1Q91V17 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Znrf1Q91V17 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Znrf1Q91V17 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Znrf1Q91V17 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Znrf1Q91V17 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Znrf1Q91V17 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Znrf1Q91V17 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Znrf1Q91V17 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Znrf1Q91V17 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,27■■□□□ 1,48
Znrf1Q91V17 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Znrf1Q91V17 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
Znrf1Q91V17 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Znrf1Q91V17 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Znrf1Q91V17 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Znrf1Q91V17 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Znrf1Q91V17 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Znrf1Q91V17 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Znrf1Q91V17 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Znrf1Q91V17 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Znrf1Q91V17 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,97■■□□□ 1,43
Znrf1Q91V17 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Znrf1Q91V17 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Znrf1Q91V17 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Znrf1Q91V17 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Znrf1Q91V17 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Znrf1Q91V17 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Znrf1Q91V17 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Znrf1Q91V17 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Znrf1Q91V17 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Znrf1Q91V17 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Znrf1Q91V17 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Znrf1Q91V17 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,76■■□□□ 1,39
Znrf1Q91V17 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Znrf1Q91V17 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Znrf1Q91V17 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Znrf1Q91V17 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Znrf1Q91V17 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Znrf1Q91V17 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Znrf1Q91V17 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Znrf1Q91V17 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Znrf1Q91V17 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Znrf1Q91V17 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Znrf1Q91V17 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Znrf1Q91V17 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Znrf1Q91V17 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Znrf1Q91V17 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Znrf1Q91V17 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Znrf1Q91V17 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,33■■□□□ 1,32
Znrf1Q91V17 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Znrf1Q91V17 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
Znrf1Q91V17 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Znrf1Q91V17 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Znrf1Q91V17 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Znrf1Q91V17 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Znrf1Q91V17 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Znrf1Q91V17 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Znrf1Q91V17 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Znrf1Q91V17 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Znrf1Q91V17 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Znrf1Q91V17 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
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