Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
P06323 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
P06323 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
P06323 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
P06323 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
P06323 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
P06323 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
P06323 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
P06323 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
P06323 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
P06323 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
P06323 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
P06323 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,88■■□□□ 1,57
P06323 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
P06323 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
P06323 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
P06323 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
P06323 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
P06323 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
P06323 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,31■■□□□ 1,48
P06323 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
P06323 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
P06323 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
P06323 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
P06323 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
P06323 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24■■□□□ 1,43
P06323 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
P06323 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
P06323 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
P06323 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
P06323 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
P06323 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,83■■□□□ 1,41
P06323 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,83■■□□□ 1,41
P06323 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
P06323 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
P06323 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
P06323 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,65■■□□□ 1,38
P06323 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
P06323 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
P06323 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
P06323 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
P06323 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
P06323 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
P06323 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
P06323 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
P06323 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,33■■□□□ 1,33
P06323 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,32■■□□□ 1,32
P06323 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
P06323 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
P06323 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
P06323 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
P06323 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
P06323 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
P06323 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
P06323 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
P06323 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
P06323 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
P06323 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
P06323 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
P06323 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
P06323 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
P06323 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
P06323 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
P06323 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
P06323 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
P06323 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
P06323 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,6■■□□□ 1,21
P06323 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
P06323 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
P06323 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,51■■□□□ 1,19
P06323 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
P06323 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
P06323 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,47■■□□□ 1,19
P06323 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,45■■□□□ 1,18
P06323 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
P06323 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
P06323 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
P06323 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
P06323 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
P06323 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
P06323 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,34■■□□□ 1,17
P06323 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
P06323 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
P06323 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
P06323 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
P06323 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
P06323 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
P06323 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,21■■□□□ 1,15
P06323 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,19■■□□□ 1,14
P06323 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
P06323 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
P06323 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
P06323 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,1■■□□□ 1,13
P06323 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
P06323 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
P06323 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
P06323 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
P06323 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
P06323 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,99■■□□□ 1,11
P06323 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms