Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
P06323 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
P06323 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
P06323 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
P06323 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P06323 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P06323 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
P06323 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
P06323 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
P06323 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P06323 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P06323 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P06323 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
P06323 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P06323 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
P06323 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P06323 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P06323 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P06323 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P06323 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
P06323 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P06323 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P06323 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P06323 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P06323 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P06323 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
P06323 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P06323 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P06323 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P06323 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P06323 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P06323 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P06323 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
P06323 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P06323 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P06323 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P06323 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P06323 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P06323 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P06323 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P06323 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P06323 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P06323 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P06323 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P06323 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
P06323 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P06323 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
P06323 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P06323 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P06323 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P06323 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P06323 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P06323 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P06323 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P06323 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P06323 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P06323 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P06323 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06323 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06323 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P06323 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P06323 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P06323 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P06323 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P06323 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06323 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P06323 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P06323 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P06323 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P06323 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P06323 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P06323 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P06323 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P06323 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P06323 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P06323 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P06323 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P06323 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P06323 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P06323 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P06323 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P06323 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P06323 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P06323 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P06323 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P06323 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P06323 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P06323 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P06323 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P06323 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P06323 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P06323 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P06323 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P06323 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P06323 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P06323 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P06323 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P06323 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P06323 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P06323 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms