Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Pax5Q02650 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pax5Q02650 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pax5Q02650 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pax5Q02650 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pax5Q02650 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pax5Q02650 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pax5Q02650 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pax5Q02650 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pax5Q02650 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pax5Q02650 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pax5Q02650 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pax5Q02650 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pax5Q02650 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pax5Q02650 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pax5Q02650 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pax5Q02650 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pax5Q02650 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pax5Q02650 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pax5Q02650 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pax5Q02650 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pax5Q02650 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pax5Q02650 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pax5Q02650 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pax5Q02650 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pax5Q02650 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pax5Q02650 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pax5Q02650 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pax5Q02650 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pax5Q02650 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pax5Q02650 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pax5Q02650 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pax5Q02650 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pax5Q02650 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pax5Q02650 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pax5Q02650 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pax5Q02650 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pax5Q02650 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pax5Q02650 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pax5Q02650 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pax5Q02650 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pax5Q02650 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pax5Q02650 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pax5Q02650 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pax5Q02650 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pax5Q02650 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pax5Q02650 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pax5Q02650 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pax5Q02650 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax5Q02650 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pax5Q02650 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pax5Q02650 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pax5Q02650 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pax5Q02650 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pax5Q02650 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pax5Q02650 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pax5Q02650 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pax5Q02650 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pax5Q02650 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pax5Q02650 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pax5Q02650 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pax5Q02650 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pax5Q02650 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pax5Q02650 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pax5Q02650 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pax5Q02650 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pax5Q02650 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pax5Q02650 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pax5Q02650 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pax5Q02650 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pax5Q02650 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pax5Q02650 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pax5Q02650 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pax5Q02650 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pax5Q02650 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pax5Q02650 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pax5Q02650 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pax5Q02650 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pax5Q02650 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pax5Q02650 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pax5Q02650 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pax5Q02650 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pax5Q02650 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pax5Q02650 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pax5Q02650 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pax5Q02650 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pax5Q02650 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pax5Q02650 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pax5Q02650 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pax5Q02650 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pax5Q02650 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pax5Q02650 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pax5Q02650 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pax5Q02650 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pax5Q02650 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax5Q02650 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pax5Q02650 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax5Q02650 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pax5Q02650 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax5Q02650 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms