Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,77■■■□□ 2,84
Gfra3O35118 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Gfra3O35118 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Gfra3O35118 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Gfra3O35118 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Gfra3O35118 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Gfra3O35118 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Gfra3O35118 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Gfra3O35118 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Gfra3O35118 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Gfra3O35118 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Gfra3O35118 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Gfra3O35118 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Gfra3O35118 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Gfra3O35118 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Gfra3O35118 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Gfra3O35118 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Gfra3O35118 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Gfra3O35118 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Gfra3O35118 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Gfra3O35118 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Gfra3O35118 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Gfra3O35118 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Gfra3O35118 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Gfra3O35118 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Gfra3O35118 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Gfra3O35118 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
Gfra3O35118 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Gfra3O35118 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Gfra3O35118 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Gfra3O35118 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Gfra3O35118 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Gfra3O35118 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Gfra3O35118 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Gfra3O35118 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Gfra3O35118 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Gfra3O35118 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Gfra3O35118 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Gfra3O35118 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Gfra3O35118 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gfra3O35118 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gfra3O35118 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gfra3O35118 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gfra3O35118 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gfra3O35118 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gfra3O35118 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gfra3O35118 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Gfra3O35118 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gfra3O35118 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gfra3O35118 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Gfra3O35118 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gfra3O35118 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gfra3O35118 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gfra3O35118 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gfra3O35118 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gfra3O35118 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Gfra3O35118 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Gfra3O35118 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Gfra3O35118 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gfra3O35118 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Gfra3O35118 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Gfra3O35118 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Gfra3O35118 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gfra3O35118 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Gfra3O35118 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Gfra3O35118 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gfra3O35118 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gfra3O35118 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gfra3O35118 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gfra3O35118 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gfra3O35118 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gfra3O35118 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Gfra3O35118 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Gfra3O35118 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,69■■□□□ 1,54
Gfra3O35118 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
Gfra3O35118 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Gfra3O35118 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Gfra3O35118 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Gfra3O35118 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Gfra3O35118 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,55■■□□□ 1,52
Gfra3O35118 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Gfra3O35118 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,49■■□□□ 1,51
Gfra3O35118 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Gfra3O35118 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Gfra3O35118 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Gfra3O35118 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Gfra3O35118 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Gfra3O35118 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Gfra3O35118 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gfra3O35118 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gfra3O35118 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gfra3O35118 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
Gfra3O35118 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Gfra3O35118 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Gfra3O35118 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gfra3O35118 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Gfra3O35118 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Gfra3O35118 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Gfra3O35118 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Gfra3O35118 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,09■■□□□ 1,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms