Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C5

Eaf1, ELL-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eaf1Q9D4C5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Eaf1Q9D4C5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Eaf1Q9D4C5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Eaf1Q9D4C5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Eaf1Q9D4C5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Eaf1Q9D4C5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Eaf1Q9D4C5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
Eaf1Q9D4C5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Eaf1Q9D4C5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Eaf1Q9D4C5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Eaf1Q9D4C5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Eaf1Q9D4C5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Eaf1Q9D4C5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Eaf1Q9D4C5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Eaf1Q9D4C5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Eaf1Q9D4C5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Eaf1Q9D4C5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Eaf1Q9D4C5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Eaf1Q9D4C5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Eaf1Q9D4C5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Eaf1Q9D4C5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Eaf1Q9D4C5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Eaf1Q9D4C5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Eaf1Q9D4C5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Eaf1Q9D4C5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Eaf1Q9D4C5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Eaf1Q9D4C5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Eaf1Q9D4C5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Eaf1Q9D4C5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Eaf1Q9D4C5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,71■■□□□ 1,55
Eaf1Q9D4C5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Eaf1Q9D4C5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Eaf1Q9D4C5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Eaf1Q9D4C5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Eaf1Q9D4C5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Eaf1Q9D4C5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Eaf1Q9D4C5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Eaf1Q9D4C5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Eaf1Q9D4C5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
Eaf1Q9D4C5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Eaf1Q9D4C5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Eaf1Q9D4C5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Eaf1Q9D4C5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Eaf1Q9D4C5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Eaf1Q9D4C5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
Eaf1Q9D4C5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Eaf1Q9D4C5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Eaf1Q9D4C5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Eaf1Q9D4C5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Eaf1Q9D4C5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Eaf1Q9D4C5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Eaf1Q9D4C5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Eaf1Q9D4C5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Eaf1Q9D4C5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Eaf1Q9D4C5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Eaf1Q9D4C5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Eaf1Q9D4C5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Eaf1Q9D4C5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Eaf1Q9D4C5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Eaf1Q9D4C5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,4■■□□□ 1,34
Eaf1Q9D4C5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,4■■□□□ 1,34
Eaf1Q9D4C5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Eaf1Q9D4C5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Eaf1Q9D4C5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Eaf1Q9D4C5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Eaf1Q9D4C5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Eaf1Q9D4C5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Eaf1Q9D4C5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Eaf1Q9D4C5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Eaf1Q9D4C5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,27■■□□□ 1,32
Eaf1Q9D4C5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Eaf1Q9D4C5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Eaf1Q9D4C5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Eaf1Q9D4C5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Eaf1Q9D4C5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Eaf1Q9D4C5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Eaf1Q9D4C5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Eaf1Q9D4C5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
Eaf1Q9D4C5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Eaf1Q9D4C5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Eaf1Q9D4C5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Eaf1Q9D4C5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Eaf1Q9D4C5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Eaf1Q9D4C5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Eaf1Q9D4C5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Eaf1Q9D4C5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Eaf1Q9D4C5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Eaf1Q9D4C5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Eaf1Q9D4C5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Eaf1Q9D4C5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Eaf1Q9D4C5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Eaf1Q9D4C5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Eaf1Q9D4C5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Eaf1Q9D4C5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Eaf1Q9D4C5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Eaf1Q9D4C5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,74■■□□□ 1,23
Eaf1Q9D4C5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Eaf1Q9D4C5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Eaf1Q9D4C5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Eaf1Q9D4C5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms