Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ifna4P07351 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ifna4P07351 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ifna4P07351 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ifna4P07351 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ifna4P07351 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifna4P07351 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifna4P07351 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifna4P07351 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ifna4P07351 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ifna4P07351 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ifna4P07351 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ifna4P07351 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ifna4P07351 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ifna4P07351 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifna4P07351 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifna4P07351 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ifna4P07351 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifna4P07351 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifna4P07351 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ifna4P07351 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifna4P07351 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifna4P07351 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifna4P07351 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifna4P07351 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifna4P07351 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifna4P07351 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifna4P07351 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifna4P07351 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifna4P07351 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifna4P07351 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifna4P07351 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifna4P07351 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifna4P07351 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifna4P07351 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifna4P07351 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifna4P07351 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifna4P07351 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifna4P07351 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifna4P07351 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifna4P07351 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifna4P07351 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifna4P07351 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ifna4P07351 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifna4P07351 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifna4P07351 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifna4P07351 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifna4P07351 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifna4P07351 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifna4P07351 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifna4P07351 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifna4P07351 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifna4P07351 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ifna4P07351 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifna4P07351 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifna4P07351 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifna4P07351 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifna4P07351 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifna4P07351 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifna4P07351 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifna4P07351 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifna4P07351 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifna4P07351 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifna4P07351 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifna4P07351 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifna4P07351 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifna4P07351 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifna4P07351 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifna4P07351 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifna4P07351 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifna4P07351 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifna4P07351 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifna4P07351 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifna4P07351 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifna4P07351 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifna4P07351 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifna4P07351 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifna4P07351 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifna4P07351 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifna4P07351 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifna4P07351 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifna4P07351 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifna4P07351 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifna4P07351 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifna4P07351 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifna4P07351 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifna4P07351 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifna4P07351 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifna4P07351 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifna4P07351 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifna4P07351 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifna4P07351 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifna4P07351 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifna4P07351 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifna4P07351 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifna4P07351 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifna4P07351 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifna4P07351 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifna4P07351 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifna4P07351 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms