RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm45800A0A1B0GT24 152 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 E430018J23RikE9PZQ8 461 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r194J3JS27 296 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Npy1rQ04573 382 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem52bQ0VBF2 186 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Taar4Q5QD15 347 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BsxQ810B3 232 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 H2-M10.6Q85ZW5 330 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ap1s2Q9DB50 160 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gpr34Q9R1K6 375 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slurp1Q9Z0K7 110 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Akirin2B1AXD8 201 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nxph4G3X9N5 304 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lhx4P53776 390 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1371Q7TQT7 311 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr654Q8VF27 341 aa12.22□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm15127B1AVZ5 449 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm15091B1AZM2 449 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zcchc24B2RVL6 241 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20873J3QMQ9 232 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20795J3QP49 232 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21310J3QQ23 232 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp5g2P56383 146 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dlx6P70397 175 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21440Q3TTD8 232 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tgfbr1Q64729 503 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 EtdQ80SW5 59 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A730015C16RikQ8C992 119 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1457Q8VFK3 317 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr344Q8VFP9 309 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RTRAFQ9CQE8 244 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnajc13D4AFX7 2248 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-26A0A075B5V0 117 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1098A2AVB0 315 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cd84Q18PI6 329 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gpr183Q3U6B2 357 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ceacam12Q3UKP4 300 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RhovQ8VDU1 236 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrpl42Q9CPV3 142 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam241aQ9CZL2 131 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ms4a4cQ9D3F6 226 aa12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tagln2Q9WVA4 199 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smco3Q8BQM7 225 aa12.21□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr960Q8VET5 316 aa12.21□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rps16P14131 146 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Oprk1P33534 380 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arrdc5Q497K5 325 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vma21Q78T54 101 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr473Q8VG44 310 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sgms2Q9D4B1 365 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 VsirQ9D659 308 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp971A2BFG8 470 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm14288E9Q9W0 88 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm37240E9QAY5 252 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sssca1P56873 199 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ShbgP97497 403 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp970Q08BU3 522 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klf14Q19A41 325 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Morn2Q6UL01 79 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1382Q7TQT3 311 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hapln4Q80WM4 400 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PirtQ8BFY0 135 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnf151Q9CQ29 239 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hspb9Q9DAM3 168 aa12.2□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20532G3UXR8 106 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm8653K9J7G2 307 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r117L7N2C9 307 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tnfaip6O08859 275 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P18530 117 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1178Q7TR20 323 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem170aQ9D342 144 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ing5Q9D8Y8 240 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnd2Q9QYM5 227 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr912A0A1L1SSS5 310 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp972A2AW65 139 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ascl5M0QWB7 188 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rab33bO35963 229 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PomcP01193 235 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cd74P04441 279 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CapgP24452 352 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rom1P32958 351 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cpne2P59108 548 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rab5bP61021 215 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rab11aP62492 216 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankrd55Q8BLD6 626 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm4894Q8CA09 118 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r26Q8R2D7 339 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ms4a3Q920C4 213 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ren2P00796 401 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RbpjP31266 526 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nabp2Q8R2Y9 212 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1295Q8VF48 312 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr786Q8VFH8 312 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 2200002J24RikQ9D807 110 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tusc2Q9WVF8 110 aa12.19□□□□□ -0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TncQ80YX1 2110 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.8 ms