Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
P18530 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
P18530 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
P18530 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
P18530 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
P18530 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
P18530 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
P18530 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
P18530 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P18530 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
P18530 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P18530 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P18530 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
P18530 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
P18530 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P18530 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P18530 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P18530 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P18530 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P18530 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P18530 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P18530 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P18530 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P18530 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P18530 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P18530 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P18530 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
P18530 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P18530 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P18530 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P18530 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P18530 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P18530 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
P18530 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P18530 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P18530 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P18530 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P18530 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P18530 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P18530 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P18530 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
P18530 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P18530 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P18530 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P18530 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
P18530 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P18530 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P18530 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P18530 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P18530 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P18530 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P18530 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P18530 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P18530 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P18530 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
P18530 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P18530 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P18530 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P18530 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
P18530 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P18530 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P18530 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P18530 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P18530 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P18530 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P18530 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P18530 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P18530 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
P18530 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P18530 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P18530 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
P18530 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P18530 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P18530 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P18530 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P18530 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P18530 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P18530 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P18530 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P18530 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P18530 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P18530 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P18530 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P18530 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P18530 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P18530 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P18530 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P18530 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P18530 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P18530 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P18530 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P18530 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P18530 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P18530 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P18530 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P18530 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P18530 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P18530 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P18530 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P18530 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms