Protein–RNA interactions for Protein: P59108

Cpne2, Copine-2, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne2P59108 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cpne2P59108 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cpne2P59108 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cpne2P59108 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpne2P59108 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpne2P59108 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cpne2P59108 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cpne2P59108 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpne2P59108 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cpne2P59108 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cpne2P59108 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpne2P59108 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpne2P59108 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpne2P59108 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpne2P59108 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpne2P59108 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpne2P59108 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne2P59108 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne2P59108 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpne2P59108 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpne2P59108 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpne2P59108 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpne2P59108 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpne2P59108 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne2P59108 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne2P59108 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne2P59108 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne2P59108 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne2P59108 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpne2P59108 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne2P59108 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpne2P59108 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne2P59108 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne2P59108 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne2P59108 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne2P59108 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne2P59108 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne2P59108 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne2P59108 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne2P59108 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne2P59108 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne2P59108 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpne2P59108 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne2P59108 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpne2P59108 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpne2P59108 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cpne2P59108 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpne2P59108 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne2P59108 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne2P59108 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne2P59108 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne2P59108 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne2P59108 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne2P59108 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne2P59108 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne2P59108 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne2P59108 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpne2P59108 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpne2P59108 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne2P59108 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne2P59108 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpne2P59108 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpne2P59108 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne2P59108 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne2P59108 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne2P59108 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne2P59108 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne2P59108 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne2P59108 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne2P59108 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne2P59108 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne2P59108 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne2P59108 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne2P59108 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne2P59108 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne2P59108 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne2P59108 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne2P59108 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne2P59108 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpne2P59108 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpne2P59108 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpne2P59108 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpne2P59108 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne2P59108 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpne2P59108 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpne2P59108 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne2P59108 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpne2P59108 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpne2P59108 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne2P59108 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne2P59108 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne2P59108 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne2P59108 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne2P59108 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne2P59108 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne2P59108 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne2P59108 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne2P59108 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne2P59108 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne2P59108 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms