Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ap1s2Q9DB50 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ap1s2Q9DB50 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap1s2Q9DB50 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap1s2Q9DB50 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap1s2Q9DB50 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ap1s2Q9DB50 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ap1s2Q9DB50 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ap1s2Q9DB50 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap1s2Q9DB50 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ap1s2Q9DB50 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ap1s2Q9DB50 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ap1s2Q9DB50 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap1s2Q9DB50 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap1s2Q9DB50 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ap1s2Q9DB50 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap1s2Q9DB50 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap1s2Q9DB50 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap1s2Q9DB50 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap1s2Q9DB50 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap1s2Q9DB50 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap1s2Q9DB50 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap1s2Q9DB50 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap1s2Q9DB50 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap1s2Q9DB50 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap1s2Q9DB50 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap1s2Q9DB50 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap1s2Q9DB50 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap1s2Q9DB50 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap1s2Q9DB50 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap1s2Q9DB50 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap1s2Q9DB50 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ap1s2Q9DB50 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap1s2Q9DB50 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap1s2Q9DB50 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap1s2Q9DB50 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap1s2Q9DB50 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ap1s2Q9DB50 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap1s2Q9DB50 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap1s2Q9DB50 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap1s2Q9DB50 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap1s2Q9DB50 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap1s2Q9DB50 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap1s2Q9DB50 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap1s2Q9DB50 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap1s2Q9DB50 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap1s2Q9DB50 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ap1s2Q9DB50 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap1s2Q9DB50 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap1s2Q9DB50 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap1s2Q9DB50 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ap1s2Q9DB50 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap1s2Q9DB50 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap1s2Q9DB50 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap1s2Q9DB50 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap1s2Q9DB50 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap1s2Q9DB50 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap1s2Q9DB50 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap1s2Q9DB50 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap1s2Q9DB50 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap1s2Q9DB50 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap1s2Q9DB50 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ap1s2Q9DB50 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap1s2Q9DB50 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap1s2Q9DB50 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap1s2Q9DB50 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap1s2Q9DB50 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap1s2Q9DB50 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap1s2Q9DB50 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap1s2Q9DB50 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap1s2Q9DB50 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap1s2Q9DB50 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1s2Q9DB50 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap1s2Q9DB50 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap1s2Q9DB50 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap1s2Q9DB50 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1s2Q9DB50 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1s2Q9DB50 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap1s2Q9DB50 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1s2Q9DB50 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap1s2Q9DB50 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1s2Q9DB50 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap1s2Q9DB50 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap1s2Q9DB50 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap1s2Q9DB50 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap1s2Q9DB50 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap1s2Q9DB50 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap1s2Q9DB50 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap1s2Q9DB50 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap1s2Q9DB50 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap1s2Q9DB50 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap1s2Q9DB50 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap1s2Q9DB50 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap1s2Q9DB50 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap1s2Q9DB50 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap1s2Q9DB50 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap1s2Q9DB50 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap1s2Q9DB50 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms