Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,7■■■□□ 2,35
Ap1s2Q9DB50 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ap1s2Q9DB50 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ap1s2Q9DB50 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ap1s2Q9DB50 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ap1s2Q9DB50 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ap1s2Q9DB50 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ap1s2Q9DB50 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ap1s2Q9DB50 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Ap1s2Q9DB50 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,76
Ap1s2Q9DB50 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Ap1s2Q9DB50 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ap1s2Q9DB50 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ap1s2Q9DB50 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ap1s2Q9DB50 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Ap1s2Q9DB50 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Ap1s2Q9DB50 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ap1s2Q9DB50 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ap1s2Q9DB50 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ap1s2Q9DB50 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ap1s2Q9DB50 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ap1s2Q9DB50 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ap1s2Q9DB50 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ap1s2Q9DB50 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ap1s2Q9DB50 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ap1s2Q9DB50 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ap1s2Q9DB50 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ap1s2Q9DB50 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Ap1s2Q9DB50 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ap1s2Q9DB50 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Ap1s2Q9DB50 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Ap1s2Q9DB50 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ap1s2Q9DB50 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Ap1s2Q9DB50 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ap1s2Q9DB50 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Ap1s2Q9DB50 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ap1s2Q9DB50 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Ap1s2Q9DB50 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ap1s2Q9DB50 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Ap1s2Q9DB50 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ap1s2Q9DB50 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ap1s2Q9DB50 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Ap1s2Q9DB50 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ap1s2Q9DB50 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Ap1s2Q9DB50 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Ap1s2Q9DB50 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,34■■□□□ 1,49
Ap1s2Q9DB50 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,48
Ap1s2Q9DB50 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Ap1s2Q9DB50 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Ap1s2Q9DB50 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Ap1s2Q9DB50 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Ap1s2Q9DB50 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ap1s2Q9DB50 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ap1s2Q9DB50 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Ap1s2Q9DB50 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ap1s2Q9DB50 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ap1s2Q9DB50 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
Ap1s2Q9DB50 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ap1s2Q9DB50 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ap1s2Q9DB50 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ap1s2Q9DB50 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ap1s2Q9DB50 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Ap1s2Q9DB50 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Ap1s2Q9DB50 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ap1s2Q9DB50 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ap1s2Q9DB50 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ap1s2Q9DB50 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ap1s2Q9DB50 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ap1s2Q9DB50 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ap1s2Q9DB50 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ap1s2Q9DB50 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ap1s2Q9DB50 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Ap1s2Q9DB50 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ap1s2Q9DB50 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ap1s2Q9DB50 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ap1s2Q9DB50 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,44■■□□□ 1,34
Ap1s2Q9DB50 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Ap1s2Q9DB50 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ap1s2Q9DB50 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Ap1s2Q9DB50 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ap1s2Q9DB50 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ap1s2Q9DB50 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ap1s2Q9DB50 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ap1s2Q9DB50 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ap1s2Q9DB50 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ap1s2Q9DB50 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ap1s2Q9DB50 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ap1s2Q9DB50 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ap1s2Q9DB50 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ap1s2Q9DB50 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ap1s2Q9DB50 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ap1s2Q9DB50 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,25■■□□□ 1,31
Ap1s2Q9DB50 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Ap1s2Q9DB50 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ap1s2Q9DB50 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ap1s2Q9DB50 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ap1s2Q9DB50 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ap1s2Q9DB50 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms