RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185852.6

Msh3-202, Transcript of DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msh3, Length 3,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3-202ENSMUST00000185852 Rab5bP61021 215 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Cd84Q18PI6 329 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Mettl4Q3U034 471 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Dhrs9Q58NB6 319 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Olfr859Q7TRF5 309 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Ss18l1Q8BW22 402 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Igkv13-84A0A140T8N3 115 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Mef2bO55087 349 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Cldn1O88551 211 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Gm9Q3UKW5 162 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Trp53rkaQ5U452 244 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Onecut2Q6XBJ3 505 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Tas2r114Q7M722 309 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Tmem204Q7TQI0 226 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Olfr1465Q7TQR2 307 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Arl6ip6Q8BH07 226 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Kazald1Q8BJ66 313 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Nup35Q8R4R6 325 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Ms4a8Q99N10 290 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Tp53rkQ99PW4 244 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Dazap1Q9JII5 406 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Myo15aQ9QZZ4 3511 aa9□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Tmem116A0A0G2JGD3 401 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 A0A286YDM5 308 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Prr23a2D3YWX5 253 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Gm21719J3KMI9 230 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 MosP00536 390 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Tcrg-V1P06325 135 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Gm10912Q3UXH0 145 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 PhyhiplQ8BGT8 375 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Commd9Q8K2Q0 198 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Nkg7Q99PA5 165 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Slc50a1Q9CXK4 221 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Tceal8Q9CZY2 117 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Lipt2Q9D009 231 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Smco4Q9JIS3 59 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Nubp1Q9R060 320 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Gm6096D3YTY6 151 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Atf6bO35451 699 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Ren2P00796 401 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 VhlP40338 181 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Cd200r3Q5UKY4 296 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Slc35e3Q6PGC7 313 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Olfr794Q8VF26 320 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Olfr101Q920Z0 308 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Sval2Q99N75 144 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Vmn1r54Q9EPB8 315 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Igkv6-15A0A140T8M5 115 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Gm45871A0A1B0GRI9 540 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Olfr1320A2AHM8 319 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 C2cd4aE9Q861 334 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Hoxa1P09022 331 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Cxcl2P10889 100 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Ier2P17950 221 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Rnf166Q3U9F6 237 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Dtx1Q61010 627 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Q9DAF8 208 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Tanc2A2A690 1994 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Gm8677K9J7G9 307 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Tnfrsf17O88472 185 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Sc5dO88822 299 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Supt4h1aP63271 117 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Fam3dP97805 223 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Gm5615Q3UW02 101 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Tsen54Q8C2A2 525 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Slc36a4Q8CH36 500 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Vmn1r222Q8R269 308 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Olfr355Q8VFP6 310 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Plrg1Q922V4 513 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 TollipQ9QZ06 274 aa8.99□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Igkv4-50A0A0B4J1J0 117 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Ighv1-76A0A0G2JFE9 117 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Igkv12-89A0A0G2JGW8 112 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 4930444P10RikD3YUR1 185 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Slc25a17O70579 307 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Chrna7P49582 502 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Lrcol1Q3URS3 161 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Slc25a35Q5SWT3 300 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 SepsecsQ6P6M7 504 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Srrm4Q8BKA3 608 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Foxn4Q8K3Q3 521 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 RpeQ8VEE0 228 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Zfp456B2RUK9 458 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Tmem139E9PX92 214 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 P01759 136 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Ifna4P07351 186 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 S100a10P08207 97 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Muc13P19467 573 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 SnrpcQ62241 159 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Sys1Q78S06 156 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Ifna16Q810G1 189 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 CrhQ8CIT0 187 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 AmtnQ9D3J8 213 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Prss22Q9ER10 306 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Gab2Q9Z1S8 665 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Gm21778A0A087WNP8 232 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 BC053393A0A0B4J1F6 192 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Zfp114B2RRA8 586 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 P06323 132 aa8.98□□□□□ -0.97
Msh3-202ENSMUST00000185852 Ccl6P27784 116 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.6 ms