Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE0

Rpe, Ribulose-phosphate 3-epimerase, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpeQ8VEE0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
RpeQ8VEE0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
RpeQ8VEE0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
RpeQ8VEE0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
RpeQ8VEE0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
RpeQ8VEE0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
RpeQ8VEE0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
RpeQ8VEE0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
RpeQ8VEE0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
RpeQ8VEE0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
RpeQ8VEE0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
RpeQ8VEE0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
RpeQ8VEE0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
RpeQ8VEE0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
RpeQ8VEE0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
RpeQ8VEE0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
RpeQ8VEE0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
RpeQ8VEE0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
RpeQ8VEE0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
RpeQ8VEE0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
RpeQ8VEE0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
RpeQ8VEE0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
RpeQ8VEE0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
RpeQ8VEE0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
RpeQ8VEE0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
RpeQ8VEE0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
RpeQ8VEE0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,95■■□□□ 1,43
RpeQ8VEE0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
RpeQ8VEE0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
RpeQ8VEE0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
RpeQ8VEE0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
RpeQ8VEE0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,73■■□□□ 1,39
RpeQ8VEE0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,65■■□□□ 1,38
RpeQ8VEE0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
RpeQ8VEE0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
RpeQ8VEE0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
RpeQ8VEE0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
RpeQ8VEE0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
RpeQ8VEE0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
RpeQ8VEE0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
RpeQ8VEE0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
RpeQ8VEE0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
RpeQ8VEE0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,06■■□□□ 1,28
RpeQ8VEE0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
RpeQ8VEE0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
RpeQ8VEE0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
RpeQ8VEE0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,96■■□□□ 1,27
RpeQ8VEE0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
RpeQ8VEE0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
RpeQ8VEE0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
RpeQ8VEE0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
RpeQ8VEE0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
RpeQ8VEE0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
RpeQ8VEE0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
RpeQ8VEE0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
RpeQ8VEE0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,75■■□□□ 1,23
RpeQ8VEE0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
RpeQ8VEE0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
RpeQ8VEE0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,71■■□□□ 1,23
RpeQ8VEE0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,66■■□□□ 1,22
RpeQ8VEE0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
RpeQ8VEE0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,62■■□□□ 1,21
RpeQ8VEE0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,61■■□□□ 1,21
RpeQ8VEE0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
RpeQ8VEE0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,58■■□□□ 1,21
RpeQ8VEE0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,57■■□□□ 1,2
RpeQ8VEE0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
RpeQ8VEE0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
RpeQ8VEE0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
RpeQ8VEE0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
RpeQ8VEE0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
RpeQ8VEE0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,46■■□□□ 1,19
RpeQ8VEE0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
RpeQ8VEE0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,44■■□□□ 1,18
RpeQ8VEE0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
RpeQ8VEE0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,32■■□□□ 1,16
RpeQ8VEE0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
RpeQ8VEE0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
RpeQ8VEE0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
RpeQ8VEE0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
RpeQ8VEE0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
RpeQ8VEE0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
RpeQ8VEE0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
RpeQ8VEE0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,11■■□□□ 1,13
RpeQ8VEE0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
RpeQ8VEE0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
RpeQ8VEE0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
RpeQ8VEE0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
RpeQ8VEE0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
RpeQ8VEE0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
RpeQ8VEE0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
RpeQ8VEE0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
RpeQ8VEE0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
RpeQ8VEE0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
RpeQ8VEE0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
RpeQ8VEE0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
RpeQ8VEE0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
RpeQ8VEE0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,94■■□□□ 1,1
RpeQ8VEE0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
RpeQ8VEE0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,86■■□□□ 1,09
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