RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055006.11

Trim16-201, Transcript of Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim16, Length 3,906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim16-201ENSMUST00000055006 BsxQ810B3 232 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pld4Q8BG07 503 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Oraov1Q8CH62 137 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr523Q8VFE7 317 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1448Q8VFX1 314 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr983Q8VG90 315 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rab31Q921E2 194 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cotl1Q9CQI6 142 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rps21Q9CQR2 83 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tex43Q9D9I1 141 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Nudt3Q9JI46 168 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 LenepQ9WVB6 61 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Flg2Q2VIS4 2362 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cnot1Q6ZQ08 2375 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Zfp931A2AHM2 298 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn1r232A2RTT5 351 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Nutf2P61971 127 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Dhrs13Q5SS80 376 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cyb561Q60720 250 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gpr6Q6YNI2 363 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr874Q7TRE6 310 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Il22ra2Q80XF5 230 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mob1bQ8BPB0 216 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 TprkbQ8QZZ7 175 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1350Q8VF34 308 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cacng8Q8VHW2 423 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ms4a3Q920C4 213 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vkorc1Q9CRC0 161 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Eaf1Q9D4C5 268 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Try5Q9QUK9 246 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Try4Q9R0T7 246 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Celsr1O35161 3034 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Eml6Q5SQM0 1958 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 P06323 132 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ifna4P07351 186 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fosl2P47930 326 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gnb1P62874 340 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 ClcP97400 68 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rhox10Q4TU83 196 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Plk3Q60806 631 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr924Q7TRB8 308 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fbxw26Q8BI58 466 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Slc37a1Q8R070 531 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr484Q8VFD3 321 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1342Q8VFY3 315 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Coa3Q9D2R6 108 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Sp5Q9JHX2 398 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm12728V9GX31 77 aa6.55□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 AU041133A0A0J9YVH3 498 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm21719J3KMI9 230 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm21310J3QQ23 232 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tnfsf12O54907 249 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 SncaO55042 140 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 TymsP07607 307 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gabra2P26048 451 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 EnsaP60840 121 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 CxadrP97792 365 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cnep1r1Q3UJ81 125 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cdkn2aQ64364 169 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 GfralQ6SJE0 393 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1371Q7TQT7 311 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cbln4Q8BME9 198 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rab11fip5Q8R361 645 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gtf3aQ8VHT7 364 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Nus1Q99LJ8 297 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Atp6v1fQ9D1K2 119 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gpr132Q9Z282 382 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Frem1Q684R7 2191 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tln2Q71LX4 2375 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr753-ps1A0A140LHN3 164 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Zfp980A2A9J5 645 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm20422E9PUR3 255 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Prss32E9Q409 334 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm8653K9J7G2 307 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn1r117L7N2C9 307 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cd79bP15530 228 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Hoxd11P23813 323 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Hspb7P35385 169 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Jsrp1Q3MI48 332 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Zfp941Q3URY5 674 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tmprss12Q3V0Q7 336 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Srsf7Q8BL97 267 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Alkbh6Q8K2U2 238 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1228Q8VGM9 323 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Derl1Q99J56 251 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tm2d1Q99MB3 208 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cmtm2bQ9DAC0 210 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 MNCb-2875Q9DCB3 74 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tet1Q3URK3 2007 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Abca1P41233 2261 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Igkv14-100A0A0G2JG36 117 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr282A1L1B4 308 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1320A2AHM8 319 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm20708H3BKF4 155 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm20873J3QMQ9 232 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm20795J3QP49 232 aa6.54□□□□□ -1.36
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pde6dO55057 150 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.6 ms