Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Cacng8Q8VHW2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cacng8Q8VHW2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cacng8Q8VHW2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacng8Q8VHW2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cacng8Q8VHW2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacng8Q8VHW2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacng8Q8VHW2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacng8Q8VHW2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacng8Q8VHW2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cacng8Q8VHW2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacng8Q8VHW2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacng8Q8VHW2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacng8Q8VHW2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cacng8Q8VHW2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacng8Q8VHW2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacng8Q8VHW2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacng8Q8VHW2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacng8Q8VHW2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacng8Q8VHW2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacng8Q8VHW2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacng8Q8VHW2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacng8Q8VHW2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacng8Q8VHW2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacng8Q8VHW2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacng8Q8VHW2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacng8Q8VHW2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacng8Q8VHW2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacng8Q8VHW2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacng8Q8VHW2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacng8Q8VHW2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacng8Q8VHW2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacng8Q8VHW2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacng8Q8VHW2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacng8Q8VHW2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacng8Q8VHW2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacng8Q8VHW2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacng8Q8VHW2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacng8Q8VHW2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacng8Q8VHW2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacng8Q8VHW2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacng8Q8VHW2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacng8Q8VHW2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacng8Q8VHW2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacng8Q8VHW2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacng8Q8VHW2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacng8Q8VHW2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacng8Q8VHW2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacng8Q8VHW2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng8Q8VHW2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng8Q8VHW2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacng8Q8VHW2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacng8Q8VHW2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacng8Q8VHW2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacng8Q8VHW2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacng8Q8VHW2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacng8Q8VHW2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacng8Q8VHW2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacng8Q8VHW2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacng8Q8VHW2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacng8Q8VHW2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacng8Q8VHW2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacng8Q8VHW2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacng8Q8VHW2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacng8Q8VHW2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacng8Q8VHW2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacng8Q8VHW2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacng8Q8VHW2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacng8Q8VHW2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacng8Q8VHW2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacng8Q8VHW2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacng8Q8VHW2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacng8Q8VHW2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacng8Q8VHW2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacng8Q8VHW2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacng8Q8VHW2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacng8Q8VHW2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng8Q8VHW2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng8Q8VHW2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng8Q8VHW2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacng8Q8VHW2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng8Q8VHW2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacng8Q8VHW2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacng8Q8VHW2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacng8Q8VHW2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacng8Q8VHW2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng8Q8VHW2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacng8Q8VHW2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacng8Q8VHW2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacng8Q8VHW2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng8Q8VHW2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacng8Q8VHW2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacng8Q8VHW2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacng8Q8VHW2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng8Q8VHW2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacng8Q8VHW2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng8Q8VHW2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng8Q8VHW2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng8Q8VHW2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng8Q8VHW2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms