Protein–RNA interactions for Protein: P61971

Nutf2, Nuclear transport factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nutf2P61971 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nutf2P61971 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nutf2P61971 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nutf2P61971 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nutf2P61971 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nutf2P61971 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nutf2P61971 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nutf2P61971 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nutf2P61971 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nutf2P61971 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nutf2P61971 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nutf2P61971 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nutf2P61971 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nutf2P61971 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nutf2P61971 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nutf2P61971 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nutf2P61971 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nutf2P61971 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nutf2P61971 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nutf2P61971 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nutf2P61971 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nutf2P61971 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nutf2P61971 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nutf2P61971 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nutf2P61971 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nutf2P61971 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nutf2P61971 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nutf2P61971 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nutf2P61971 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nutf2P61971 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nutf2P61971 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nutf2P61971 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nutf2P61971 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nutf2P61971 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nutf2P61971 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nutf2P61971 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nutf2P61971 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nutf2P61971 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nutf2P61971 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nutf2P61971 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nutf2P61971 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nutf2P61971 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nutf2P61971 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nutf2P61971 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nutf2P61971 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nutf2P61971 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nutf2P61971 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nutf2P61971 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nutf2P61971 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nutf2P61971 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nutf2P61971 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nutf2P61971 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nutf2P61971 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nutf2P61971 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nutf2P61971 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nutf2P61971 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nutf2P61971 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nutf2P61971 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nutf2P61971 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nutf2P61971 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nutf2P61971 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nutf2P61971 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nutf2P61971 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nutf2P61971 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nutf2P61971 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nutf2P61971 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nutf2P61971 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nutf2P61971 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nutf2P61971 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nutf2P61971 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nutf2P61971 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nutf2P61971 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nutf2P61971 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nutf2P61971 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nutf2P61971 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nutf2P61971 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nutf2P61971 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nutf2P61971 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nutf2P61971 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nutf2P61971 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nutf2P61971 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nutf2P61971 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nutf2P61971 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nutf2P61971 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nutf2P61971 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nutf2P61971 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nutf2P61971 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nutf2P61971 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nutf2P61971 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nutf2P61971 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nutf2P61971 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nutf2P61971 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nutf2P61971 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nutf2P61971 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nutf2P61971 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nutf2P61971 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nutf2P61971 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nutf2P61971 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nutf2P61971 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nutf2P61971 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms