Protein–RNA interactions for Protein: Q60806

Plk3, Serine/threonine-protein kinase PLK3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plk3Q60806 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Plk3Q60806 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plk3Q60806 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Plk3Q60806 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plk3Q60806 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plk3Q60806 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Plk3Q60806 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Plk3Q60806 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Plk3Q60806 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Plk3Q60806 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Plk3Q60806 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plk3Q60806 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Plk3Q60806 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Plk3Q60806 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plk3Q60806 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Plk3Q60806 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plk3Q60806 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plk3Q60806 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plk3Q60806 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plk3Q60806 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plk3Q60806 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plk3Q60806 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plk3Q60806 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plk3Q60806 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plk3Q60806 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plk3Q60806 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plk3Q60806 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Plk3Q60806 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plk3Q60806 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plk3Q60806 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plk3Q60806 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Plk3Q60806 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plk3Q60806 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plk3Q60806 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plk3Q60806 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plk3Q60806 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plk3Q60806 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plk3Q60806 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plk3Q60806 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plk3Q60806 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plk3Q60806 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plk3Q60806 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plk3Q60806 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plk3Q60806 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Plk3Q60806 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plk3Q60806 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plk3Q60806 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plk3Q60806 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plk3Q60806 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plk3Q60806 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Plk3Q60806 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plk3Q60806 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plk3Q60806 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plk3Q60806 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plk3Q60806 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Plk3Q60806 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plk3Q60806 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plk3Q60806 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plk3Q60806 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plk3Q60806 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plk3Q60806 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plk3Q60806 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plk3Q60806 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plk3Q60806 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plk3Q60806 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Plk3Q60806 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plk3Q60806 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plk3Q60806 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plk3Q60806 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plk3Q60806 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plk3Q60806 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plk3Q60806 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Plk3Q60806 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plk3Q60806 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plk3Q60806 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plk3Q60806 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plk3Q60806 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plk3Q60806 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plk3Q60806 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plk3Q60806 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plk3Q60806 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plk3Q60806 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plk3Q60806 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plk3Q60806 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plk3Q60806 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plk3Q60806 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plk3Q60806 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Plk3Q60806 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plk3Q60806 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plk3Q60806 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plk3Q60806 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plk3Q60806 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plk3Q60806 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plk3Q60806 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plk3Q60806 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Plk3Q60806 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plk3Q60806 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plk3Q60806 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plk3Q60806 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plk3Q60806 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms