RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021424.4

Sptlc2-201, Transcript of Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sptlc2, Length 6,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Spsb2O88838 264 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rgp1Q8BHT7 391 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm9945Q8BNZ3 91 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ighv6-3A0A075B5T2 118 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Zfp983E9PUT0 460 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Igf2P09535 180 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Aqp3Q8R2N1 292 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Chchd2Q9D1L0 153 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Q9DAF8 208 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Loxl2P58022 776 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rtn4rQ99PI8 473 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 SdhcQ9CZB0 169 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nat8f4G5E8L3 226 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm21310J3QQ23 232 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cnn1Q08091 297 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mettl27Q8BGM4 238 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr702Q920Z2 318 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gpr34Q9R1K6 375 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Csn3P06796 181 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr123Q8VFQ1 309 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dda1Q9D9Z5 102 aa13.15□□□□□ -0.3
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ighv5-9A0A075B5Q2 117 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pef1Q8BFY6 275 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Map1lc3aQ91VR7 121 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr1118A0A0J9YUE7 307 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trav12-2A0N8N6 114 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm17430F6RSK3 157 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Defa-rs10Q64263 91 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Slc35d2Q762D5 326 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Parp16Q7TMM8 322 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trav15-2-dv6-2A0A075B650 123 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm16503Q8C6M9 103 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cd74P04441 279 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr876Q7TRE4 310 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Phf7Q9DAG9 307 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Col4a1P02463 1669 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm21244J3QK38 227 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Egr1P08046 533 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Psmg4P0C7N9 123 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 MiaQ61865 130 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr25Q7TRD6 313 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 DapQ91XC8 102 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dram1Q9DC58 238 aa13.14□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 H3BKT1 185 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 C1saQ8CG14 688 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Znrf1Q91V17 227 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Spint5J3KMK8 105 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 C1ql1O88992 258 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 NgfrQ9Z0W1 417 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Igkv6-20A0A140T8P2 115 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm45871A0A1B0GRI9 540 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Defa-rs2P17534 91 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 UcnP81615 122 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm9772F6XPD8 135 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 CirbpP60824 172 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Prss21Q9JHJ7 324 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mmp16Q9WTR0 607 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Phlda3Q9WV95 125 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr177E9Q7W1 309 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Hapln4Q80WM4 400 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Lrrc3bQ8VCH9 259 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 RhovQ8VDU1 236 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Necap2Q9D1J1 266 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmem160Q9D938 188 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pgpep1Q9ESW8 209 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ssbp4Q3U4B1 363 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr1199Q8VF94 310 aa13.13□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr902E9Q6Z7 309 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Slc16a4Q8R0M8 500 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr958Q8VEY3 312 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Igkv6-25A0A140T8N7 115 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr191L7N1Z8 309 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Defa-rs7P50715 91 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ucp3P56501 308 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Faap20Q3UN58 186 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nabp2Q8R2Y9 212 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Q8VCE4 163 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 P03976 113 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 SbpP15501 199 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cdkn1bP46414 197 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Olfr816Q8VFU2 312 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tnfrsf13cQ9D8D0 175 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Scn8aQ9WTU3 1978 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 BC024063A0A1W2P7G7 749 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm20532G3UXR8 106 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 D430019H16RikJ3QPM6 83 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 P01759 136 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tbr1Q64336 681 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cacng8Q8VHW2 423 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rnf115Q9D0C1 305 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmem54Q9D7S1 219 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nup205A0A0J9YUD5 2061 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Psg17Q62056 475 aa13.12□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Scgb2a2J3KMP9 96 aa13.11□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Scgb1b3J3QJY4 93 aa13.11□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 TirapQ99JY1 241 aa13.11□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 SmpxQ9DC77 85 aa13.11□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trem3Q9JKE1 183 aa13.11□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm1673Q3UR78 90 aa13.11□□□□□ -0.31
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.2 ms