Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,57■■■□□ 2,64
Mmp16Q9WTR0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Mmp16Q9WTR0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Mmp16Q9WTR0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Mmp16Q9WTR0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Mmp16Q9WTR0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Mmp16Q9WTR0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Mmp16Q9WTR0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Mmp16Q9WTR0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Mmp16Q9WTR0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Mmp16Q9WTR0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Mmp16Q9WTR0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Mmp16Q9WTR0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Mmp16Q9WTR0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Mmp16Q9WTR0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Mmp16Q9WTR0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Mmp16Q9WTR0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Mmp16Q9WTR0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Mmp16Q9WTR0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Mmp16Q9WTR0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Mmp16Q9WTR0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Mmp16Q9WTR0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Mmp16Q9WTR0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Mmp16Q9WTR0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Mmp16Q9WTR0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Mmp16Q9WTR0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Mmp16Q9WTR0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Mmp16Q9WTR0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Mmp16Q9WTR0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Mmp16Q9WTR0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Mmp16Q9WTR0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
Mmp16Q9WTR0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Mmp16Q9WTR0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Mmp16Q9WTR0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Mmp16Q9WTR0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Mmp16Q9WTR0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Mmp16Q9WTR0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Mmp16Q9WTR0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Mmp16Q9WTR0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Mmp16Q9WTR0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Mmp16Q9WTR0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Mmp16Q9WTR0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Mmp16Q9WTR0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Mmp16Q9WTR0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Mmp16Q9WTR0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Mmp16Q9WTR0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Mmp16Q9WTR0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Mmp16Q9WTR0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Mmp16Q9WTR0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Mmp16Q9WTR0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Mmp16Q9WTR0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Mmp16Q9WTR0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Mmp16Q9WTR0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Mmp16Q9WTR0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Mmp16Q9WTR0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Mmp16Q9WTR0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Mmp16Q9WTR0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Mmp16Q9WTR0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Mmp16Q9WTR0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Mmp16Q9WTR0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Mmp16Q9WTR0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Mmp16Q9WTR0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Mmp16Q9WTR0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Mmp16Q9WTR0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Mmp16Q9WTR0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Mmp16Q9WTR0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Mmp16Q9WTR0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,89■■□□□ 1,57
Mmp16Q9WTR0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Mmp16Q9WTR0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Mmp16Q9WTR0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Mmp16Q9WTR0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Mmp16Q9WTR0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Mmp16Q9WTR0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Mmp16Q9WTR0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Mmp16Q9WTR0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Mmp16Q9WTR0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Mmp16Q9WTR0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Mmp16Q9WTR0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Mmp16Q9WTR0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Mmp16Q9WTR0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Mmp16Q9WTR0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Mmp16Q9WTR0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Mmp16Q9WTR0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Mmp16Q9WTR0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,54■■□□□ 1,52
Mmp16Q9WTR0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Mmp16Q9WTR0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Mmp16Q9WTR0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Mmp16Q9WTR0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Mmp16Q9WTR0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Mmp16Q9WTR0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Mmp16Q9WTR0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Mmp16Q9WTR0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Mmp16Q9WTR0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Mmp16Q9WTR0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Mmp16Q9WTR0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Mmp16Q9WTR0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Mmp16Q9WTR0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Mmp16Q9WTR0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Mmp16Q9WTR0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Mmp16Q9WTR0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms