Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Rtn4rQ99PI8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rtn4rQ99PI8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rtn4rQ99PI8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rtn4rQ99PI8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rtn4rQ99PI8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtn4rQ99PI8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtn4rQ99PI8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rtn4rQ99PI8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtn4rQ99PI8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtn4rQ99PI8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtn4rQ99PI8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtn4rQ99PI8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rtn4rQ99PI8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rtn4rQ99PI8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtn4rQ99PI8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtn4rQ99PI8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtn4rQ99PI8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtn4rQ99PI8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rtn4rQ99PI8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rtn4rQ99PI8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4rQ99PI8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4rQ99PI8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtn4rQ99PI8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtn4rQ99PI8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtn4rQ99PI8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rtn4rQ99PI8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtn4rQ99PI8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtn4rQ99PI8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtn4rQ99PI8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtn4rQ99PI8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rtn4rQ99PI8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rtn4rQ99PI8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rtn4rQ99PI8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtn4rQ99PI8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtn4rQ99PI8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtn4rQ99PI8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtn4rQ99PI8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtn4rQ99PI8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtn4rQ99PI8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtn4rQ99PI8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rtn4rQ99PI8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rtn4rQ99PI8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rtn4rQ99PI8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rtn4rQ99PI8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rtn4rQ99PI8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rtn4rQ99PI8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rtn4rQ99PI8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtn4rQ99PI8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtn4rQ99PI8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtn4rQ99PI8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtn4rQ99PI8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtn4rQ99PI8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtn4rQ99PI8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtn4rQ99PI8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtn4rQ99PI8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4rQ99PI8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtn4rQ99PI8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtn4rQ99PI8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtn4rQ99PI8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtn4rQ99PI8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4rQ99PI8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn4rQ99PI8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtn4rQ99PI8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtn4rQ99PI8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtn4rQ99PI8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtn4rQ99PI8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtn4rQ99PI8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtn4rQ99PI8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtn4rQ99PI8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4rQ99PI8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4rQ99PI8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtn4rQ99PI8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtn4rQ99PI8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtn4rQ99PI8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtn4rQ99PI8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtn4rQ99PI8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtn4rQ99PI8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtn4rQ99PI8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtn4rQ99PI8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtn4rQ99PI8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rtn4rQ99PI8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtn4rQ99PI8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtn4rQ99PI8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtn4rQ99PI8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtn4rQ99PI8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtn4rQ99PI8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtn4rQ99PI8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtn4rQ99PI8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtn4rQ99PI8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtn4rQ99PI8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4rQ99PI8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4rQ99PI8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtn4rQ99PI8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtn4rQ99PI8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtn4rQ99PI8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4rQ99PI8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtn4rQ99PI8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtn4rQ99PI8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtn4rQ99PI8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms