RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C CCP1P00431 361 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C SBP1P10080 294 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C SPT15P13393 240 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C RNQ1P25367 405 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C LDB16P25587 256 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C CBF2P32504 956 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C ALR2P43553 858 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C IKS1P47042 667 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C CTF18P49956 741 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C PRP24P49960 444 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C HST3P53687 447 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C PPM1Q04081 328 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C YMR018WQ04364 514 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C UFO1Q04511 668 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C PMT7Q06644 662 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C MLH2Q07980 695 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C TCO89Q08921 799 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C GUP2Q08929 609 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C YPL216WQ08964 1102 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C TFB4Q12004 338 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C SVS1Q12254 260 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C SEC39Q12745 709 aa3.98□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C CHS2P14180 963 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C DAL81P21657 970 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C PPH21P23594 369 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C PRS1P32895 427 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C MIA40P36046 403 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C KIC1P38692 1080 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C LAM1P38851 1228 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C MGS1P40151 587 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C RPT2P40327 437 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C BUD6P41697 788 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C BST1P43571 1029 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C CPR7P47103 393 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C HXT16P47185 567 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C PMT3P47190 753 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C HLJ1P48353 224 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C HXT15P54854 567 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C COG8Q04632 607 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C BSC6Q08280 497 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C ARP7Q12406 477 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C ECM3Q99252 613 aa3.97□□□□□ -1.77
SUP53tL(CAA)C COX11P19516 300 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C YCR006CP25350 157 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C PSO2P30620 661 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C ABD1P32783 436 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C SEC6P32844 805 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C TFC3P34111 1160 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C YKL050CP35736 922 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C YKL151CP36059 337 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C YJR079WP47126 109 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C PRM1P53835 661 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C RTC4P53850 401 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C AIM32Q04689 311 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C PSR2Q07949 397 aa3.96□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data3.95□□□□□ -1.78not detected
SUP53tL(CAA)C CDC9P04819 755 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C MPH2P0CD99 609 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C RED1P14291 827 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C CEM1P39525 442 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C RTT101P47050 842 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C TAN1P53072 289 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C AIM14P53109 570 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C YLR012CQ07927 99 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C YOL024WQ08172 172 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C MDM38Q08179 573 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C GYP1Q08484 637 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C YOL098CQ12496 1037 aa3.95□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C ENO1P00924 437 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C LEU1P07264 779 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C TUB1P09733 447 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C HOP09932 586 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C PDC5P16467 563 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C MSB1P21339 1137 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C YIH1P25637 258 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C RIM101P33400 625 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C MUM2P38236 366 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C RFC5P38251 354 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C YHL017WP38745 532 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C TIM17P39515 158 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C STL1P39932 569 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C VNX1P42839 908 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C GLG2P47011 380 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C MND1P53102 219 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C RSC1P53236 928 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C VAC7P53950 1165 aa3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C ADE12P80210 433 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C STE20Q03497 939 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C GLN4P13188 809 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C ADH7P25377 361 aa3.93□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SUP53tL(CAA)C ALY1P36117 915 aa3.93□□□□□ -1.78
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