RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W ROD1Q02805 837 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SMC5Q08204 1093 aa10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W ATP2P00830 511 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W TIF1P10081 395 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W MEI4P29467 408 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W BUD2P33314 1104 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W RRN3P36070 627 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W PDX3P38075 228 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SWC5P38326 303 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SPR3P41901 512 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W RPA14P50106 137 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SHE4P51534 789 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W RTT102P53330 157 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SRL4Q03085 281 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W CRF1Q04930 467 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SVF1Q05515 481 aa10.57□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data10.56□□□□□ -0.72not detected
PRP4YPR178W TUB1P09733 447 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SAN1P22470 610 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W VPS34P22543 875 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W CLB2P24869 491 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W GFD2P25370 566 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SNL1P40548 159 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W STB1P42845 420 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W FMP32P43557 207 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W TAH11P47112 604 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W YTP1P53584 459 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W DSL1P53847 754 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SQS1P53866 767 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W KRE28Q04431 385 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W ATG26Q06321 1198 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W PEX15Q08215 383 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W MCH5Q08777 521 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W NCR1Q12200 1170 aa10.56□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SEM1O94742 89 aa10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W TGL1P34163 548 aa10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W TIF3P34167 436 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W YKL222CP35995 705 aa10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W DBP7P36120 742 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W CKB2P38930 258 aa10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W POL31P46957 487 aa10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W ASN1P49089 572 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W ASI2P53895 289 aa10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W YNL058CP53947 316 aa10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SPC2Q04969 178 aa10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W IES4Q08561 116 aa10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W OSW2Q12202 724 aa10.55□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W AMS1P22855 1083 aa10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SPC42P36094 363 aa10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W EXO84P38261 753 aa10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W QNS1P38795 714 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W NPT1P39683 429 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W CCT7P42943 550 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W BNA3P47039 444 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W ORC5P50874 479 aa10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W YNL108CP53929 270 aa10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W PRO2P54885 456 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W CDC55Q00362 526 aa10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SPH1Q06160 661 aa10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W ASA1Q06822 443 aa10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W KCS1Q12494 1050 aa10.54□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SUI3P09064 285 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W PHO89P38361 574 aa10.53□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W BZZ1P38822 633 aa10.53□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SND1Q04007 877 aa10.53□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W YET2Q04210 160 aa10.53□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W AAD15Q08361 143 aa10.53□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W STB3Q12427 513 aa10.53□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W URA10P30402 227 aa10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SEC1P30619 724 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W CYM1P32898 989 aa10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W GGA2P38817 585 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W UTP9P38882 575 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W ERP2P39704 215 aa10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W TGL3P40308 642 aa10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W INP51P40559 946 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W RSC8P43609 557 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data10.52□□□□□ -0.72 RIP-Chip
PRP4YPR178W TRF5P48561 642 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W TFB3Q03290 321 aa10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W TRS130Q03660 1102 aa10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W RAD30Q04049 632 aa10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
PRP4YPR178W PUT4P15380 627 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W KIN82P25341 720 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YCR015CP25616 317 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W RPS5P26783 225 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W ZIP1P31111 875 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W MRP4P32902 394 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W ATO2P32907 282 aa10.52□□□□□ -0.73
PRP4YPR178W YBL036CP38197 257 aa10.52□□□□□ -0.73
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