RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C RAD3P06839 778 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C ADE3P07245 946 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C DCW1P36091 449 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C HSL7P38274 827 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C CBR1P38626 284 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PFS1P38872 237 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C LYS9P38999 446 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C TMA108P40462 946 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C KTR7P40504 517 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C AIM23P47015 356 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PEX31P53203 462 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C KTR6P54070 446 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YAT1P80235 687 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YCS4Q06156 1176 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YPR078CQ06813 372 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PER33Q12144 273 aa7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data7.24□□□□□ -1.25not detected
SPE3YPR069C SEC63P14906 663 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C NIP100P33420 868 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PXA2P34230 853 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C VPS24P36095 224 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PSY4P38193 441 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C LAM1P38851 1228 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C VAC8P39968 578 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C IML2P47031 731 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C COQ5P49017 307 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C NPY1P53164 384 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YDL073WQ07454 984 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C AAD4Q07747 329 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C VPS5Q92331 675 aa7.24□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C ENO1P00924 437 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YPK1P12688 680 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C SEC1P30619 724 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C GYP6P32806 458 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C EXO5P38289 585 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C URA8P38627 578 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C OCA5P38738 679 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C TDA3P38758 523 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PRM9P39551 298 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YER189WP40104 122 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C HXT8P40886 569 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C SNG1P46950 547 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C TAD1P53065 400 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C TAN1P53072 289 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C SXM1Q04175 944 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C ARA2Q04212 335 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C TMA16Q08687 178 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C SAM4Q08985 325 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YLR046CQ12253 270 aa7.23□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C MIS1P09440 975 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C TUP1P16649 713 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C DAL81P21657 970 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C VMA4P22203 233 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C GEX1P25596 615 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C SMC1P32908 1225 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PDR3P33200 976 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C GEX2P36173 615 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C FUI1P38196 639 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C KAP104P38217 918 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C FSH1P38777 243 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YHR078WP38799 552 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C EDC3P39998 551 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YGL140CP53120 1219 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C AQR1P53943 586 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C ERV41Q04651 352 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C GRX8Q05926 109 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C OPI10Q08202 246 aa7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C COX3P00420 269 aa7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C MET16P18408 261 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C RVS167P39743 482 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C TIF34P40217 347 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C SER33P40510 469 aa7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C SUM1P46676 1062 aa7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C MNN10P50108 393 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C PRM1P53835 661 aa7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C PIR1Q03178 341 aa7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C SND1Q04007 877 aa7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C YDR222WQ04925 415 aa7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C PEX15Q08215 383 aa7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C APL5Q08951 932 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C HIS1P00498 297 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C ERG6P25087 383 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C APM3P38153 483 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C LEU5P38702 357 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C STL1P39932 569 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C YPS6P40583 537 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C SAP185P40856 1058 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C AMA1P50082 593 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C YNR063WP53749 607 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C YNL108CP53929 270 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C ORC3P54790 616 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C ADI1Q03677 179 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C INP2Q03824 705 aa7.2□□□□□ -1.26
SPE3YPR069C YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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