RNA–Protein interactions for RNA: YOR249C

APC5, Transcript of Subunit of the Anaphase-Promoting Complex/Cyclosome (APC/C), yeast

Gene APC5, Length 2,058 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APC5	YOR249C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	TIM50	Q02776	476 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	TMA10	Q06177	86 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	YFT2	Q06676	274 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	TRM8	Q12009	286 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	MED1	Q12321	566 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	ENT1	Q12518	454 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	SEC12	P11655	471 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.67	□□□□□ -1.82	not detected
APC5	YOR249C	SAN1	P22470	610 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	BCS1	P32839	456 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	VFA1	P40080	203 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	PIG2	P40187	538 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	AMA1	P50082	593 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	TFC6	Q06339	672 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	ENB1	Q08299	606 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	LAS17	Q12446	633 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	RTP1	Q12751	981 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	MET3	P08536	511 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	BET2	P20133	325 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	IMP2'	P32351	346 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	LST4	P34239	828 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	STB5	P38699	743 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	NPR3	P38742	1146 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	YEL068C	P39977	110 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	TMN3	P40071	706 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	HOS4	P40480	1083 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	BAP3	P41815	604 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	POL31	P46957	487 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	RFX1	P48743	811 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	CBK1	P53894	756 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	FDC1	Q03034	503 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	TRS31	Q03337	283 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	DLT1	Q04216	342 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	SOD2	P00447	233 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	YER010C	P40011	234 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	INP52	P50942	1183 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	IMA1	P53051	589 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	VPS64	Q03944	604 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	ICL2	Q12031	575 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APC5	YOR249C	CTT1	P06115	562 aa		3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	YCR015C	P25616	317 aa		3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	PAH1	P32567	862 aa		3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	YBR053C	P38235	358 aa		3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	VPS8	P39702	1274 aa		3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	ELO3	P40319	345 aa		3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	ESL1	P40456	1118 aa		3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	ATG21	Q02887	496 aa		3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	AAC3	P18238	307 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	DCG1	P32460	244 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	CNS1	P33313	385 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	TOD6	P34219	525 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	RIM8	P53179	542 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	SNO4	Q04902	237 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	ADY4	Q05955	493 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	HSP32	Q08992	237 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	COX17	Q12287	69 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	ZRT2	Q12436	422 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	TPK1	P06244	397 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	VPS33	P20795	691 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	PRP28	P23394	588 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	BCD1	P38772	366 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	YJL193W	P39542	402 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	YEL025C	P39991	1188 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	CDA2	Q06703	312 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	IRC13	Q08630	104 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	PCD1	Q12524	340 aa		3.64	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.63	□□□□□ -1.83	not detected
APC5	YOR249C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	LRO1	P40345	661 aa		3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	BST1	P43571	1029 aa		3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	SRB7	P47822	140 aa		3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	TEL2	P53038	688 aa		3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	HOF1	Q05080	669 aa		3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	DSS4	P32601	143 aa		3.63	□□□□□ -1.83
APC5	YOR249C	REV7	P38927	245 aa		3.63	□□□□□ -1.83

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