RNA–Protein interactions for RNA: YMR219W

ESC1, Transcript of Protein localized to the nuclear periphery, yeast

Gene ESC1, Length 4,977 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ESC1	YMR219W	PEX31	P53203	462 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MRPL50	P53724	139 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RNH1	Q04740	348 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	GSY1	P23337	708 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PEX1	P24004	1043 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PPH3	P32345	308 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ANP1	P32629	500 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YKU70	P32807	602 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MDL2	P33311	773 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PTC4	P38089	393 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	LDH1	P38139	375 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	FAA3	P39002	694 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PCI8	P40512	444 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	AXL1	P40851	1208 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YGR111W	P53265	400 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	TAF12	Q03761	539 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MLC2	Q06580	163 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YLL058W	Q12198	575 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MNL2	Q12205	849 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MRPL8	P22353	238 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CWH43	P25618	953 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YHI9	P38765	294 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YER186C	P40101	306 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	JLP2	P40206	208 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YTA12	P40341	825 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CAB2	P40506	365 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	VPS25	P47142	202 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ENT3	P47160	408 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	VPS70	P47161	811 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	THI22	Q06490	572 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	GIC2	Q06648	383 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	XYL2	Q07993	356 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	VPS54	Q12071	889 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	DAS2	Q12084	232 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	VPS3	P23643	1011 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SCJ1	P25303	377 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RAD27	P26793	382 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RRN3	P36070	627 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RCK2	P38623	610 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	KIC1	P38692	1080 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	APE4	P38821	490 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RMR1	P53060	241 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ORC3	P54790	616 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	UBX5	Q06682	500 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YOL036W	Q08206	761 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RIM20	Q12033	661 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	TFC8	Q12308	588 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	VCX1	Q99385	411 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YER152C	P10356	443 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RGT1	P32862	1170 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MRPL17	P36528	281 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	VHC1	P38329	1120 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SMF1	P38925	575 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	NPP2	P39997	493 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RPC17	P47076	161 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CTF18	P49956	741 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	NUT1	P53114	1132 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	INA17	Q02888	182 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	USA1	Q03714	838 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	GRX8	Q05926	109 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	DXO1	Q06349	442 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ARP6	Q12509	438 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	PCD1	Q12524	340 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	YLR278C	Q05854	1341 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	BI4	P03879	638 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	SRD1	P09007	221 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	RDS1	P25611	832 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	OAF3	P36023	863 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	TPO5	P36029	618 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	MTG2	P38860	518 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ESC1	YMR219W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.2 ms